Где я могу найти набор данных по анатомии человека, который легко читать/использовать программно?

Я ищу набор данных по анатомии человека, который дает мне иерархические отношения между частями тела/костями/мышцами.

Я нашел такие наборы данных, как UMLS и GALEN, которые представляют собой большие наборы данных RDF/OWL, которые дают мне такие данные, но я обнаружил, что получение подмножества данных, которые я хочу, довольно сложно - в основном из-за отсутствия библиотек/инструментов .NET для OWL и моего незнания этой области.

Я уверен, что в конечном итоге смогу что-то получить от них, если потребуется, но мне было интересно, знает ли кто-нибудь о меньшем/более простом наборе данных. Мы готовы заплатить за это, если это необходимо, так как время имеет решающее значение.

Что-то вроде ниже, но для всего тела (здесь мы можем быть довольно гибкими... нам просто нужно, чтобы оно было маленьким/простым)

<Arm>
  <Bones>
      <Humerus/>
      <Raduius/>
      <Ulna/>
  </Bones>
  <Muscles>
   ...
  </Muscles>
</Arm>

Я искал в Интернете что-то подобное и не нашел ничего на этом уровне простоты, но с необходимой детализацией.

Заранее спасибо.


person Martyn    schedule 01.05.2012    source источник
comment
Онтология FMA и тройки данных: sig.biostr.washington. edu/share/downloads/fma/release/latest/   -  person Eng. Samer T    schedule 01.05.2017


Ответы (3)


Основополагающая модель анатомии доступна в mysql, однако она может быть не такой простой, как вам хотелось бы. http://sig.biostr.washington.edu/projects/fm/index.html

В FAQ есть инструкции по установке: http://sig.biostr.washington.edu/projects/fma/release/v3.2.1/FMA_instructions.html

person Abby    schedule 01.05.2012
comment
Спасибо за это, я скачаю и посмотрю. Я думаю, что наличие его в БД будет реальной помощью. - person Martyn; 01.05.2012


Также в http://sparql.bioontology.org/ граф <http://bioportal.bioontology.org/ontologies/FMA> содержит RDF-контент FMA.

person Manuel Salvadores    schedule 02.05.2012
comment
Можно ли загружать контент или данные, реализующие онтологии в BioPortal? - person Eng. Samer T; 01.05.2017
comment
Это зависит от лицензии конкретных онтологий. Большинство из них можно загрузить в исходном формате, RDF и CSV. - person Manuel Salvadores; 01.05.2017