преобразование файлов слоев в объем

в области радиологии существует множество способов сканирования части или даже всего тела. мне нужно преобразовать много медицинских dicom-файлов (> 100 слоев) в один файл тома, чтобы передать 3d-объем вместо 2d-данных. один формат — это формат .nrrd, используемый здесь:

xtk

я знаю, что есть slicer, но есть ли другой способ конвертировать файлы? кто-нибудь сталкивался с этим?

заранее спасибо


person p0rter    schedule 24.05.2012    source источник


Ответы (1)


вы можете использовать mri_convert из пакета freesurfer.

http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/

Затем просто сделайте

mri_convert *.dcm output.mgz

и вы получаете формат .MGZ, который может читать XTK :)

person haehn    schedule 12.06.2012