Я пишу простую симуляцию Монте-Карло для переноса частиц. Мой подход заключается в написании ядра для CUDA и выполнении его как функции Mathematica.
Ядро:
#include "curand_kernel.h"
#include "math.h"
extern "C" __global__ void monteCarlo(Real_t *transmission, mint seed, mint pathN) {
curandState rngState;
int index = threadIdx.x + blockIdx.x*blockDim.x;
curand_init(seed, index, 0, &rngState);
if (index < pathN) {
//-------------start one packet run----------------------
float packetWeight = 1.0;
int m = 0;
while(packetWeight > 0.0){
//MONTE CARLO CODE
// Test: still in the sample?
if(z_coordinate > sampleThickness){
packetWeight = 0;
z_coordinate = sampleThickness;
transmission[index]=1;
}
}
}
//-------------end one packet run------------------------
}
}
Математический код:
Needs["CUDALink`"];
cudaBM = CUDAFunctionLoad[code,
"monteCarlo", {{_Real, "Output"}, _Integer, _Integer}, 256,
"UnmangleCode" -> False];
pathN = 100000;
result = 0; (*count for transmitted particles*)
For[j = 0, j < 10, j++,
buffer = CUDAMemoryAllocate["Float", 100000];
cudaBM[buffer, 1490, pathN];
resultOneRun = Total[CUDAMemoryGet[buffer]];
result = result + resultOneRun;
];
Вроде пока все работает, но прирост скорости по сравнению с чистым кодом на C без CUDA незначителен. У меня две проблемы:
- функция curand_init() выполняется всеми потоками в начале каждого шага суммирования -> могу ли я вызвать эту функцию один раз для всех потоков?
- ядро возвращает Mathematica очень большой массив вещественных чисел (100 000). Я знаю, что узким местом CUDA является пропускная способность канала между GPU и CPU. Мне нужна только сумма всех элементов списка, поэтому было бы эффективнее вычислить сумму элементов списка в GPU и отправить в CPU только одно вещественное число.
CUDATotal
? - person b.gatessucks   schedule 09.01.2013CUDATotal
будет выполняться после того, как массив результатов будет скопирован обратно в память процессора. Я хочу избежать копирования всего массива результатов в память процессора. Я думаю, что решение должно быть в части C кода. Благодарю за ваш ответ. - person user1961006   schedule 09.01.2013