Извлечь строки в текстовом файле с помощью grep

for line in `cat text.txt`; do grep $line input.txt >> output.txt; done

Содержание text.txt:

ABCB8
ABCC12
ABCC3
ABCC4
AHR
ALDH4A1
ALDH5A1

Изменить:

Более безопасное решение с while read:

cat text.txt | while read line; do grep "$line" input.txt >> output.txt; done

Редактировать 2:

Образец text.txt:

ABCB8
ABCB8XY
ABCC12

Образец input.txt:

You were hired to do a job; we expect you to do it.
You were hired because ABCB8 you kick ass;
we expect you to kick ass.
ABCB8XY You were hired because you can commit to a rational deadline and meet it;
ABCC12 we'll expect you to do that too.
You're not someone who needs a middle manager tracking your mouse clicks

Если вас не волнует порядок строк, быстрым обходным решением будет передача решения через sort | uniq:

cat text.txt | while read line; do grep "$line" input.txt >> output.txt; done; cat output.txt | sort | uniq > output2.txt

Результат тогда в output.txt.

Редактировать 3:

 cat text.txt | while read line; do grep "\<${line}\>" input.txt >> output.txt; done

Это нормально?

Вы можете использовать флаг -f, как описано в Bash, Linux, необходимо удалить строки из одного файла на основе соответствия содержимого из другого файла

grep -o -f file.txt input.txt > output.txt

Флаг

• -f FILE, --file=FILE:

Получить шаблоны из ФАЙЛА, по одному на строку. Пустой файл не содержит шаблонов и поэтому ничему не соответствует. (-f определяется POSIX.)

• -o, --only-matching:

Печатать только совпадающие (непустые) части совпадающей строки, причем каждая такая часть находится в отдельной строке вывода.