Загрузить dicom-файлы

Я пытаюсь просмотреть (несжатые) файлы dicom с помощью XTK. Однако браузер ничего не показывает, хотя вроде загружается нормально.

Имеет ли значение, что срезы из файлов DICOM горизонтальны? В Уроке 15 на странице https://github.com/xtk/X#readme фрагменты вертикальный. Файлы dicom взяты из http://www.osirix-viewer.com/datasets/ ( набор данных BRAINX).

Заранее спасибо!


dicom xtk
person user2546761    schedule 03.07.2013    source источник
comment
Недавно в анализаторе DICOM была обнаружена ошибка, из-за которой срезы вообще не отображались. Я настоятельно рекомендую вам попробовать еще раз, используя файлы Xtk из репозитория.   -  person E_net4 the curator    schedule 08.07.2013
comment
Какие-нибудь сообщения в консоли? Chrome F12 и Firefox Ctrl+Shift+K   -  person Grant    schedule 24.07.2013
comment
Также нажмите и перетащите вниз. Я заметил проблему с файлами dicom, заключающуюся в том, что программа чтения dicom сглаживает изображение в трехмерном пространстве и размещает его на плоскости вместо создания объема.   -  person Grant    schedule 25.07.2013

Ответы (2)


arrow_upward
0
arrow_downward

Похоже, с последней версией XTK Edge все работает нормально (https://github.com/xtk/X#readme< /а>). Не могли бы вы указать нам на нерабочий набор данных?

В какой-то момент вы можете увидеть «белый шум» вместо фактического изображения. Скорее всего, это связано с тем, что DICOM сжат в формате JPEG. XTK еще не поддерживает это. Чтобы обойти это, вы можете распаковать DICOM с помощью dcmtk "dcmdjpeg" (http://support.dcmtk.org/docs/dcmdjpeg.html)

Спасибо

person Nicolas    schedule 23.10.2013
comment
«Знаменитые» наборы данных Osirix хранятся с использованием JPEG 2000. Таким образом, вы не можете использовать DCMTK, если не купите частные модули. - person malat; 29.10.2013
comment
Спасибо за информацию, я только что просмотрел 1 набор данных, который, похоже, использует синтаксис передачи JPEG без потерь. - person Nicolas; 29.10.2013
comment
На странице, на которую ссылается OP, указано: (Все эти файлы DICOM закодированы в синтаксисе передачи JPEG2000). Я думаю, вам нужно повторно загрузить файлы DICOM. - person malat; 30.10.2013

arrow_upward
0
arrow_downward

Поскольку набор данных Osirix хранится с использованием синтаксиса передачи JPEG 2000, вам в значительной степени необходимо использовать gdcm:

$ gdcmconv --raw osirix_dataset.dcm output_raw.dcm

См. справочную страницу gdcmconv.

Модуль DCMTK/JPEG 2000 не является бесплатным, см. здесь.

person malat    schedule 29.10.2013