Мне нужно, чтобы оба моих файла выравнивания были в формате бабочки и samtools, чтобы я мог передать их в разные программы позже в моем конвейере. Есть ли какой-либо метод, который я могу использовать для преобразования файла выравнивания sam в файл выравнивания галстука-бабочки и наоборот?
В качестве альтернативы можно было бы выполнить выравнивание дважды и заставить программу-бабочку выводить его в разных форматах в каждом случае. Однако это тратит слишком много времени.
