В графе DOT, как переместить кластер и предотвратить ненужное пересечение линий?

Я использую Graphviz для создания этой диаграммы:

Выход не оптимальный. Линия XZ без необходимости пересекает линию XY; Я ожидаю, что Y будет выше X. Я пробовал много вариантов из документа, но безрезультатно. Вот какой результат я ожидаю:

Как я могу заставить Graphviz создавать более оптимизированные диаграммы?

ПРИМЕЧАНИЕ. Я хотел бы автоматизировать создание подобных диаграмм, поэтому решения, характерные для описанного выше сценария (например, невидимые ребра из X0 -> Y1, Y11 -> X03 или еще что-то), не помогут. Я ищу способ, чтобы в целом доверять таким вещам, как:

• А-Х-В будет прямой линией.
• Y будет выше A-X-B, если он не взаимодействует с Z.
• X->Y->X не будет без необходимости вызывать большие промежутки между узлами X.

Содержимое точечного файла:

digraph G {
  rankdir=LR

  subgraph cluster_x {
    node [style=filled,color=green]
    "X.0" -> "X.0.1" -> "X.0.2" -> "X.0.3" -> "X.0.4"
  }

  subgraph cluster_y {
    node [style=filled,color=lightblue]
    "Y.1" -> "Y.1.1"
  }

  subgraph cluster_z {
    node [style=filled,color=crimson]
    "Z.1" -> "Z.1.1"
    "Z.2"
  }

  A -> "X.0"
  "X.0.1" -> "Y.1"
  "X.0.1" -> "Z.2"
  "X.0.2" -> "Z.1"
  "Y.1.1" -> "X.0.2"
  "Z.1.1" -> "X.0.4"
  "Z.2" -> "Z.1.1"
  "X.0.4" -> B
}