Можно ли показать скрытые символы в CodeMirror?

Возврат каретки специально интерпретируется CodeMirror (когда он сам по себе, он создает разрыв строки, когда перед переводом строки он будет игнорироваться), поэтому в этом случае нет, вы не можете.

Но другие непечатаемые символы (например, \b) по умолчанию будут отображаться в виде красных точек, и вы можете адаптировать соответствующий класс CSS cm-invalidchar, чтобы настроить их внешний вид.

Это можно сделать с помощью оверлеев и предопределенных стилей с пробелами и символом EOL следующим образом:

cm.addOverlay({
    name: 'invisibles',
    token:  function nextToken(stream) {
        var ret,
            spaces  = 0,
            peek    = stream.peek() === ' ';

        if (peek) {
            while (peek && spaces < Maximum) {
                ++spaces;

                stream.next();
                peek = stream.peek() === ' ';
            }

            ret = 'whitespace whitespace-' + spaces;
        } else {
            while (!stream.eol() && !peek) {
                stream.next();

                peek = stream.peek() === ' ';
            }

            ret = 'cm-eol';
        }

        return ret;
    }
});

Для этой цели вы можете использовать аддон CodeMirror Show Invisibles.