1-й столбец в inFile содержит строку, которая не обязательно присутствует во всех inFile

2-й и 7-й столбцы в каждом inFile содержат строки Title#

Используя AWK, я не могу правильно собрать это воедино. Надеюсь, использование описательных переменных поможет прояснить, что я пытаюсь сделать. Вот компоненты, которые, как мне кажется, мне нужны:

1. входные файлы, разделенные табуляцией: -F'\t'
2. увеличьте строки в 1-м столбце, но добавьте каждое «имя» только один раз в «1stColumnNames»: !1stColumnNames[$1]++ { name[++i] = $1 }
3. создайте новый индекс для каждого файла .tsv, чтобы хранить значения для каждого файла, чтобы избежать перезаписи значений каждого столбца: !r[FILENAME]++ { ++argind }
4. сохранить соответствующие значения столбцов во 2-м и 7-м столбцах для каждого файла: { 2ndColumnVals[$1, argind] = $2 } { 7thColumnVals[$1, argind] = $7 }
5. распечатать все 1stColumnNames со связанными 2ndColumnVals и 7thColumnVals, включая их заголовки «Title1», «Title2», «Title3» и т. д.: ?????
6. значения индекса, которые были пустыми для определенного 2ndColumnVals или 7thColumnVals, печатаются как Mtee: ?????
7. сделайте это для всех файлов .tsv в текущем рабочем каталоге и выведите новый файл tsv: *.tsv > outFile.tsv

Примеры файлов

inFile1.tsv

Names   Title1  Title2
AAAA    1111    123456
BBBBB   1111    123456
CCC     1111    123456

inFile2.tsv

Names   Title3  Title4
BBBBB   2222    789456
DDDDD   2222    789456
EEEE    2222    789456

inFile3.tsv

Names   Title5  Title6
AAAA    3333    987654
CCC     3333    987654
EEEE    3333    987654

outFile123.tsv

Names   Title1  Title2  Title3  Title4  Title5  Title6
AAAA    1111    123456  Mtee    Mtee    3333    987654  
BBBBB   1111    123456  2222    789456  Mtee    Mtee
CCC     1111    123456  Mtee    Mtee    3333    987654
DDDDD   Mtee    Mtee    2222    789456  Mtee    Mtee
EEEE    Mtee    Mtee    2222    789456  3333    987654

Тестовый сценарий

GNU Awk 4.0.1 находится в /usr/bin/awk, поэтому я создал этот файл и запустил его в том же рабочем каталоге, где расположены 3 входных файла:

#### Example Usage:  script1.sh inFile1.tsv inFile2.tsv inFile3.tsv > outFile123.tsv

awk -F'\t' '
FNR==1 { ++numFiles}
!seen[$1]++ { keys[++numKeys] = $1 }
{ a[$1,numFiles] = $2 FS $3 }
END {
    for (keyNr=1; keyNr<=numKeys; keyNr++) {
        key = keys[keyNr]
        printf "%s", key
        for (fileNr=1;fileNr<=numFiles;fileNr++) {
            printf "\t%s", ((key,fileNr) in a ? a[key,fileNr] : "Mtee\tMtee")
        }
        print ""
    }
}
' "$@"

Запуск awk -F script1.awk inFile1.tsv inFile2.tsv inFile3.tsv > outFile123.tsv выводит следующие сообщения об ошибках:

awk: cmd. line:1: inFile1.tsv

awk: cmd. line:1: ^ syntax error

Тестовый скрипт 2 из konsolebox

работает отлично, но я пытаюсь понять каждую строку, комментируя:

#!/usr/bin/awk -f
#### named as script2.awk
#### Example Usage:  awk -f script2.awk inFile1.tsv inFile2.tsv inFile3.tsv > outFile123.tsv

BEGIN { FS = "\t" } #input File Style is tab-delimited
{ sub(/\r/, "") }   #remove all carriage return characters
!f[FILENAME]++ { ++indx }   #for all files inputted make a single index called indx
!a[$1]++ { keys[i++] = $1 } #the new indx comprises only unique strings in column 1
{ b[$1, indx] = $2 FS $3 }  #the 2nd and 3rd column are tab delimited and each pair that corresponds to a string saved in keys gets stored after the 1st column string in matrix b
END {
    for (i = 0; i in keys; ++i) {   #????
        key = keys[i]   #????
        printf "%s", keys   #prints out all strings in the index column 1 stored as keys
        for (j = 1; j <= indx; ++j) {   #????
            v = b[key, j]   #????
            printf "\t%s", length(v) ? v : "Mtee" FS "Mtee" #print out strings as tab delimited and replace any lengths of 1 char to two Mtee separated by a tab
        }
        print ""    #????
    }
}