Создайте матрицу смежности из графического файла входного набора данных с помощью редактора Matlab.

Используйте sparse для построения матрицы:

x = [4 6
     0 1
     1 3
     2 3
     1 2
     0 2
     0 3]; %// data

adjMatrix = sparse(x(2:end,1)+1, x(2:end,2)+1, 1, x(1,1), x(1,2));

Получается разреженная матрица. При необходимости вы можете преобразовать в полную форму:

adjMatrix = full(adjMatrix);

В вашем примере это дает

adjMatrix =

     0     1     1     1     0     0
     0     0     1     1     0     0
     0     0     0     1     0     0
     0     0     0     0     0     0

Чтобы сделать граф симметричным (неориентированным):

s = max(x(1,1), x(1,2)); %// take largest dimemsion
adjMatrix = sparse(x(2:end,1)+1, x(2:end,2)+1, 1, s, s); %// now matrix is square
adjMatrix = adjMatrix | adjMatrix.'; %'// apply "or" with transpose to make symmetric
adjMatrix = full(adjMatrix); %// convert to full if needed

Если у вас есть данные в файле, вы можете считать их в переменную x, используя textread. Например, если файл data.txt содержит текст

4     6
0     1
1     3
2     3
1     2
0     2
0     3

просто используйте

x = textread('data.txt');

Затем вы можете применить вышеизложенное для создания adjMatrix из x.