CDI PostConstruct с использованием поставщика услуг

Это нормальное поведение. Метод @PostConstruct вызывается, когда bean-компонент инициализируется контейнером. См. Справочник по сварке:

Немного упрощая, все происходит в таком порядке:

• Сначала контейнер вызывает конструктор компонента (конструктор по умолчанию или конструктор с аннотацией @Inject), чтобы получить экземпляр
  компонента.

• Далее контейнер инициализирует значения всех введенных полей бина.

• Далее контейнер вызывает все методы инициализации бина (порядок вызова не переносимый, не полагайтесь на него).
• Наконец, вызывается метод @PostConstruct, если он есть.

Однако в случае метода производителя у вас есть полный контроль над тем, как создается объект, поэтому вы можете самостоятельно вызвать любой необходимый метод. Обратите внимание, что в методах производителя объект обычно создается с использованием new, поэтому аннотированные поля не инициализируются. Снова проверьте документацию по методу производителя для возможного решения. (внедрение в методы производителя, @New)

Кажется плохой практикой использовать производителя для всего — почему вы используете производителя, если ваши классы аннотированы @PostConstruct?

Один из способов сделать это — использовать создающий контекст внутри вашего метода производителя, чтобы предоставить ссылку, а затем вызвать пост-конструкцию для этой ссылки. Вот пример кода, взятый из Apache DeltaSpike, набора расширений CDI:

BeanProvider

    BeanManager beanManager = getBeanManager();

    CreationalContext creationalContext = beanManager.createCreationalContext(null);

    AnnotatedType annotatedType = beanManager.createAnnotatedType(instance.getClass());
    InjectionTarget injectionTarget = beanManager.createInjectionTarget(annotatedType);
    injectionTarget.inject(instance, creationalContext);
    injectionTarget.postConstruct(instance);