Выбор функции

Я пытаюсь найти полезный метод выбора признаков в наборе из 20000 генов из выражения set(microarray), чтобы получить модель только с полезными генами. Я попытался использовать RFE из каретки, но получил stackOverflow, так как обратный выбор не поддерживает данные, где n(predictors) > n(samples). Может ли кто-нибудь предложить разумный способ сделать это или решение для этого метода выбора RFE?

Заранее спасибо.


person M. Hallal    schedule 09.11.2015    source источник


Ответы (1)


Вы пытались использовать генетические алгоритмы для выбора признаков? Для этого есть разные пакеты - GA, genalg, Caret (в R).

Взгляните на этот блог, выбор функций с использованием генетических алгоритмов был объяснен на примере - http://topepo.github.io/caret/GA.html

Надеюсь, поможет.

person akashrajkn    schedule 27.11.2015