Поднимите исключение с более высокого уровня, а-ля предупреждения

Иногда обработчику исключений может быть полезно намеренно повторно вызвать исключение, чтобы предоставить дополнительную информацию или преобразовать исключение в другой тип. Атрибут __cause__ предоставляет явный способ записать прямую причину исключения.

Когда Exception возникает с атрибутом __cause__, сообщение трассировки принимает форму:

Traceback (most recent call last):
 <CAUSE TRACEBACK>

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
  <MAIN TRACEBACK>

Насколько я понимаю, это именно то, чего вы пытаетесь достичь; четко указать, что причина ошибки не в вашем модуле, а в другом месте. Если вместо этого вы пытаетесь опустить информацию в трассировку, как предлагает ваше edit, то остальная часть этого ответа не принесет вам никакой пользы.

Замечание о синтаксисе:

Атрибут __cause__ в объектах исключения всегда инициализируется значением None. Он задается новой формой оператора «рейз»:

   raise EXCEPTION from CAUSE

что эквивалентно:

    exc = EXCEPTION
    exc.__cause__ = CAUSE
    raise exc

так что минимальный пример будет примерно таким:

def function():
    int("fail")

def check_raise(function):
    try:
        function()
    except Exception as original_error:
        err = RuntimeError("An exception was raised.")
        raise err from original_error

check_raise(function)

что дает такое сообщение об ошибке:

Traceback (most recent call last):
  File "/PATH/test.py", line 7, in check_raise
    function()
  File "/PATH/test.py", line 3, in function
    int("fail")
ValueError: invalid literal for int() with base 10: 'fail'

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
  File "/PATH/test.py", line 12, in <module>
    check_raise(function)
  File "/PATH/test.py", line 10, in check_raise
    raise err from original_error
RuntimeError: An exception was raised.

Однако первая строка причины - это инструкция в блоке try строки check_raise:

  File "/PATH/test.py", line 7, in check_raise
    function()

поэтому перед повышением err может быть (а может и не быть) желательно удалить самый внешний фрейм трассировки из original_error:

except Exception as original_error:
    err = RuntimeError("An exception was raised.")
    original_error.__traceback__ = original_error.__traceback__.tb_next
    raise err from original_error

Таким образом, единственная строка в трассировке, которая, по-видимому, исходит от check_raise, - это самый последний оператор raise, который нельзя пропустить с чистым кодом Python, хотя в зависимости от того, насколько информативным является сообщение, вы можете очень четко указать, что ваш модуль не был причиной проблема:

err = RuntimeError("""{0.__qualname__} encountered an error during call to {1.__module__}.{1.__name__}
the traceback for the error is shown above.""".format(function,check_raise))

Преимущество создания такого исключения заключается в том, что исходное сообщение Traceback не теряется при возникновении новой ошибки, а это означает, что может быть вызвана очень сложная серия исключений, и python по-прежнему будет правильно отображать всю соответствующую информацию:

def check_raise(function):
    try:
        function()
    except Exception as original_error:
        err = RuntimeError("""{0.__qualname__} encountered an error during call to {1.__module__}.{1.__name__}
the traceback for the error is shown above.""".format(function,check_raise))
        original_error.__traceback__ = original_error.__traceback__.tb_next
        raise err from original_error

def test_chain():
    check_raise(test)

def test():
    raise ValueError

check_raise(test_chain)

дает мне следующее сообщение об ошибке:

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/Tadhg/Documents/test.py", line 16, in test
    raise ValueError
ValueError

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/Tadhg/Documents/test.py", line 13, in test_chain
    check_raise(test)
  File "/Users/Tadhg/Documents/test.py", line 10, in check_raise
    raise err from original_error
RuntimeError: test encountered an error during call to __main__.check_raise
the traceback for the error is shown above.

The above exception was the direct cause of the following exception:

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/Tadhg/Documents/test.py", line 18, in <module>
    check_raise(test_chain)
  File "/Users/Tadhg/Documents/test.py", line 10, in check_raise
    raise err from original_error
RuntimeError: test_chain encountered an error during call to __main__.check_raise
the traceback for the error is shown above.

Да, он длинный, но он значительно информативнее, чем:

Traceback (most recent call last):
  File "/Users/Tadhg/Documents/test.py", line 18, in <module>
    check_raise(test_chain)
RuntimeError: An exception was raised.

не говоря уже о том, что исходная ошибка все еще может использоваться, даже если программа не заканчивается:

import traceback

def check_raise(function):
    ...

def fail():
    raise ValueError

try:
    check_raise(fail)
except RuntimeError as e:
    cause = e.__cause__
    print("check_raise failed because of this error:")
    traceback.print_exception(type(cause), cause, cause.__traceback__)

print("and the program continues...")