Как запустить .ipynb Jupyter Notebook с терминала?

Из командной строки вы можете преобразовать записную книжку в Python с помощью этой команды:

jupyter nbconvert --to python nb.ipynb

https://github.com/jupyter/nbconvert

Возможно, вам придется установить пакет python mistune:

sudo pip install -U mistune

nbconvert позволяет запускать записные книжки с флагом --execute:

jupyter nbconvert --execute <notebook>

Если вы хотите запустить записную книжку и создать новую записную книжку, вы можете добавить --to notebook:

jupyter nbconvert --execute --to notebook <notebook>

Или, если вы хотите заменить существующую записную книжку новым выводом:

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace <notebook>

Поскольку это очень длинная команда, вы можете использовать псевдоним:

alias nbx="jupyter nbconvert --execute --to notebook"
nbx [--inplace] <notebook>

Вы можете экспортировать весь свой код из .ipynb и сохранить его как .py скрипт. Затем вы можете запустить сценарий в своем терминале.

Надеюсь, это поможет.

В вашем Терминале запустите ipython:

ipython

затем найдите свой сценарий и поместите туда:

%run your_script.ipynb

Для новой версии вместо:

ipython nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb

Вы можете использовать jupyter для ipython:

jupyter nbconvert --to python <YourNotebook>.ipynb

В моем случае мне больше всего подошла команда:

jupyter nbconvert --execute --clear-output <notebook>.ipynb

Почему? Эта команда не создает дополнительных файлов (как файл .py), и вывод ячеек перезаписывается каждый раз при запуске записной книжки.

Если вы запустите:

jupyter nbconvert --help

--clear-output Очистить вывод текущего файла и сохранить на месте, перезаписав существующую записную книжку.

Обновление с цитированием комментария автора для большей наглядности:

Примечание автора: «Этот проект был запущен до Jupyter execute API, который теперь является рекомендуемым способом запуска записных книжек из командной строки. Считайте runipy устаревшим и неподдерживаемым». - Себастьян Пальма

Установите библиотеку runipy, которая позволяет запускать ваш код на терминале

pip install runipy

После компиляции кода:

runipy <YourNotebookName>.ipynb

Вы также можете попробовать cronjob. Вся информация находится здесь

Вы также можете использовать пакет boar для запуска записной книжки в коде Python.

from boar.running import run_notebook

outputs = run_notebook("nb.ipynb")

Если вы обновите свой блокнот, вам не придется снова конвертировать его в файл Python.

Более подробная информация по адресу:

https://github.com/alexandreCameron/boar/blob/master/USAGE.md

С терминала запустить

jupyter nbconvert --execute --to notebook --inplace --allow-errors --ExecutePreprocessor.timeout=-1 my_nb.ipynb

Тайм-аут по умолчанию составляет 30 секунд. -1 снимает ограничение.

Если вы хотите сохранить выходной блокнот в новый блокнот, вы можете использовать флаг --output my_new_nb.ipynb

У меня была та же проблема, и я нашел бумажную фабрику. Преимущество перед другими решениями в том, что вы можете видеть результаты во время работы ноутбука. Мне эта функция интересна, когда ноутбук занимает очень много времени. Он очень прост в использовании:

pip install papermill
papermill notebook.ipynb output.ipynb

У него также есть другие удобные опции, такие как сохранение выходного файла в Amazon S3, Google Cloud и т. Д. См. Страницу для получения дополнительной информации.

Используя ipython:

ipython --TerminalIPythonApp.file_to_run=<notebook>.ipynb

Обычно я бы предпочел этот вариант, поскольку он действительно самоописуемый. Если вы предпочитаете использовать меньше символов, используйте:

ipython -c "%run <notebook>.ipynb"

это в основном то, что Keto уже предлагалось (к сожалению, немного скрыто) как комментарий.