Почему я получаю ошибку сегментации?

Вы не выделили место для буфера.
Указатель str — это просто висячий указатель. Таким образом, ваша программа эффективно сбрасывает данные, считанные из файла, в область памяти, которой вы не владеете, что приводит к ошибке сегментации.

Тебе нужно:

char *str;
str = malloc(BUFSIZ); // this is missing..also free() the mem once done using it.

или просто:

char str[BUFSIZ]; // but then you can't do str++, you'll have to use another 
                  // pointer say char *ptr = str; and use it in place of str.

ИЗМЕНИТЬ:

Есть еще одна ошибка:

while (fgets(str, sizeof BUFSIZ, file))

Второй аргумент должен быть BUFSIZ, а не sizeof BUFSIZ.

Почему?

Потому что 2-й аргумент — это максимальное количество символов, которое нужно прочитать в буфер, включая нулевой символ. Поскольку sizeof BUFSIZ равно 4, вы можете прочитать максимум до 3 символов в буфер. Вот почему 19381 читалось как 193, а затем как 81<space>.

Вы не выделили памяти для заполнения str. fgets принимает в качестве первого аргумента буфер, а не неназначенный указатель.

Вместо char *str; вам нужно определить буфер разумного размера, скажем, char str[BUFSIZ];

Потому что вы не выделили место для своего буфера.

Несколько человек уже обратились к проблеме, о которой вы спрашивали, но у меня есть ответный вопрос. Как вы думаете, что именно это дает:

        if (isdigit(*str))
        {
            if (isdigit(*str))
            {
                sum += atoi(str);
                str++;
                while (isdigit(*str))
                    str++;
                continue;
            }
        }

В чем смысл двух последовательных операторов if с одним и тем же условием? (Примечание для протокола: ни у одного из них нет пункта else).

Вы объявили char* str, но еще не выделили для нее память. Вам нужно будет выделить память для этого.

Многие ошибки, связанные с памятью, такие как эта, могут быть легко обнаружены с помощью valgrind. Я настоятельно рекомендую использовать его в качестве инструмента отладки.

char *str;

str не имеет выделенной для него памяти. Либо используйте malloc(), чтобы выделить для него немного памяти, либо объявите его с предопределенным размером.

char str[MAX_SIZE];

Ваша программа имеет несколько ошибок:

• Он неправильно обрабатывает длинные строки. Когда вы читаете буфер некоторого размера, может случиться так, что некоторое число начинается в конце буфера и продолжается в начале следующего буфера. Например, если у вас есть буфер размером 4, это может быть вход The |numb|er 1|2345| is |larg|e., где вертикальные линии указывают содержимое буфера. Затем вы будете считать 1 и 2345 отдельно.
• Он вызывает isdigit с аргументом char. Как только вы читаете любой "большой" символ (больше SCHAR_MAX), поведение становится неопределенным. Ваша программа может дать сбой, или выдать неверные результаты, или сделать что угодно. Чтобы исправить это, вы должны сначала привести значение к unsigned char, например isdigit((unsigned char) *str). Или, как в моем коде, вы можете передать ему значение из функции fgetc, которое гарантированно будет допустимым аргументом для isdigit.
• Вы используете функцию, которой требуется буфер (fgets), но не можете выделить буфер. Как отмечали другие, самый простой способ получить буфер — объявить локальную переменную char buffer[BUFSIZ].
• Вы используете переменную str для двух целей: для хранения адреса буфера (который должен оставаться постоянным в течение всего времени выполнения) и указателя для анализа текста (который изменяется во время выполнения). Сделайте эти две переменные. Я бы назвал их buffer и p (сокращение от указатель).

Вот мой код:

#include <ctype.h>
#include <stdio.h>

static int sumNumbers(const char *filename)
{
    int sum, num, c;
    FILE *f;

    if ((f = fopen(filename, "r")) == NULL) {
        /* TODO: insert error handling here. */
    }

    sum = 0;
    num = 0;
    while ((c = fgetc(f)) != EOF) {
        if (isdigit(c)) {
            num = 10 * num + (c - '0');
        } else if (num != 0) {
            sum += num;
            num = 0;
        }
    }

    if (fclose(f) != 0) {
        /* TODO: insert error handling here. */
    }

    return sum;
}

int main(int argc, char **argv) {
    int i;

    for (i = 1; i < argc; i++)
        printf("%d\t%s\n", sumNumbers(argv[i]), argv[i]);
    return 0;
}

Вот функция, которая выполняет вашу работу:

static int sumNumbers(char* filename) {
    int sum = 0;
    FILE *file = fopen(filename, "r");
    char buf[BUFSIZ], *str;

    while (fgets(buf, BUFSIZ, file))
    {
            str=buf;
            while (*str)
            {
                    if (isdigit(*str))
                    {
                            sum += strtol(str, &str, 10);
                    }
                    str++;
            }
    }
    fclose(file);
    return sum;
}

Это не включает обработку ошибок, но работает достаточно хорошо. Для вашего файла вывод будет

Сумма всех чисел в файле: 19483