Я хочу запустить обмен ребрами по методу Монте-Карло, т. Е. Выбрать два существующих ребра в графе равномерно случайным образом, а затем (если выполняются некоторые условия) поменять местами их конечные точки.
В настоящее время я использую boost::random_edge
для равномерного случайного выбора ребер.
#include <boost/graph/adjacency_list.hpp>
#include <boost/graph/erdos_renyi_generator.hpp>
#include <boost/random/mersenne_twister.hpp>
#include <boost/random/variate_generator.hpp>
#include <boost/graph/random.hpp>
#include <boost/random/linear_congruential.hpp>
int main(int argc, char* argv[]) {
typedef boost::adjacency_list<boost::setS,boost::vecS,boost::undirectedS> Graph;
typedef boost::erdos_renyi_iterator<boost::minstd_rand, Graph> ERGen;
typedef boost::uniform_int<> UniformIntDistr;
typedef boost::variate_generator<boost::mt19937&, UniformIntDistr> IntRNG;
// make random graph
int n = 17000;
boost::graph_traits<Graph>::edges_size_type m = 250000;
boost::minstd_rand gen;
Graph g(ERGen(gen, n, m), ERGen(), n);
// make random number generator
boost::mt19937 rng;
UniformIntDistr dis(0, num_edges(g)-1);
IntRNG gen_int(rng, dis);
// select two edges uniformly at random (a million times)
Graph::edge_descriptor e1;
Graph::edge_descriptor e2;
for (int i=0; i<1000000;i++) {
Graph::edge_descriptor e1 = boost::random_edge(g, gen_int);
Graph::edge_descriptor e2 = boost::random_edge(g, gen_int);
};
}
Для графов с >250 тыс. ребер это оказывается довольно медленным; каждое использование random_edge
занимает от 1 до 10 миллисекунд. В предыдущей версии, запуск которой занимал столько же времени, я использовал std::advance
на edges(g).first
(с gen_int
, как указано выше). В этой версии std::advance
занимало львиную долю времени вычислений.
Я предполагаю, что все работало бы намного быстрее, если бы я мог получить итератор произвольного доступа для edges(g)
, аналогичный произвольному доступу к вершинам здесь.
Однако я был бы открыт и для других подходов. Должен быть какой-то способ сделать это, потому что в random_rewire в графическом инструменте, который работает намного быстрее, чем мой код.
random_rewire
команда graph-tool делает именно то, что мне нужно (создает график с заданной матрицей ассортативности степени-степени), поэтому в итоге я снова переключился на graph- инструмент для достижения наилучших результатов. - person Alice Schwarze   schedule 19.12.2016