Не могу отменить изменения файлов в git

Когда я объединился с другой веткой, некоторые из моих файлов изменились автоматически.
Я попытался checkout -- изменить файлы, но git status по-прежнему показывает их как измененные.

Затем я попробовал пользовательскую функцию оболочки, которая обычно решает для меня такие проблемы:

cd `git rev-parse --show-toplevel`;
git reset --hard HEAD && git clean -d -f;
cd -; 
git rm -r --cached .
git reset --hard HEAD

Файлы по-прежнему отображаются как измененные.

Я пробовал запускать эти фрагменты команд через разные версии:

git config --global core.autocrlf true
git config --global core.autocrlf false
git config --global core.autocrlf input

Файлы по-прежнему отображаются как измененные.
Мне просто нужен чистый git status...

Есть ли команда, которая гарантированно сделает это?