Как добиться использования последовательности внутри оператора CASE MSSQL

Вместо прямой вставки в целевую таблицу сначала создайте временную таблицу и сначала установите идентификатор как нулевой, где необходимо установить последовательность. После этого обновите временную таблицу, строки идентификаторов которой равны нулю. После этого вставьте в целевую таблицу из временной таблицы.

Select case when @something = 1 then cast(null as int)
       else ID ends id,
       value
into #temp
from temp_test;

update #temp
set id = next value for [your_seq]
where id is null;

Возможно, вы имеете в виду что-то вроде этого:

declare @value INT

SELECT @value = CAST(current_value AS INT) 
FROM sys.sequences WHERE name = 'temp_test';

IF (1=1)
    select  @value = next value for temp_test;


select 
'value1',
'value2',
@value

Непонятно, почему вам нужно, чтобы все это было в одном выборе, но мне кажется, что это нарушает некоторые правила, когда ваш выбор может иметь или не иметь значения для базы данных во время выполнения.

Возможно, вы сможете использовать identity, чтобы делать то, что хотите, или вы сможете написать это по-другому, но вы не объясните, что вы действительно пытаетесь сделать (например, загрузить новый ключ в таблицу?), поэтому больше не могу помочь