Я снова здесь с другим вопросом, касающимся SimpleITK в python. Я хочу построить изображение .mhd, но я не знаю, как это сделать. Я пробую описанную здесь функцию Чтение формата *.mhd/*.raw в python< /а>:
load_itk('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')
Но он не читает изображение:
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:483:
itk::ERROR: MetaImageIO(0x3a83730): File cannot be read: /home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd for reading.
Reason: Success
Я тоже пробовал с изображением scikit...
img = io.imread('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd', plugin='simpleitk')
но я также получаю сообщение об ошибке
RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK ReadImage: /tmp/SimpleITK-build/ITK/Modules/IO/Meta/src/itkMetaImageIO.cxx:483:
itk::ERROR: MetaImageIO(0x3a84280): File cannot be read: /home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd for reading.
Reason: Success
Даже с медпомощью
from medpy.io import load
image_data, image_header = load('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')
Traceback (most recent call last):
File "<pyshell#17>", line 1, in <module>
image_data, image_header = load('/home/bianca/Documents/PythonProcessing/result-Edep.mhd')
File "medpy/io/load.py", line 201, in load
raise err
DependencyError: Loading images of type Itk/Vtk MetaImage (.mhd, .mha/.raw) requires a third-party module that could not be encountered. Reason: No module named itk.
Но теперь у меня есть SimpleITK. Я не понимаю, что происходит... =(