Как сгенерировать Java-код из диаграммы последовательности в визуальной парадигме?

Это должно быть вызвано тем, что вы выбрали неправильную папку в качестве исходной папки для выполнения преобразовать исходный код в диаграмму последовательности. Исходная папка, которую вы указали, должна быть родительской папкой корня вашего исходного кода, т. е. если ваши классы находятся в пакете типа com.vp.sample, вам следует выбрать родительскую папку "com " в качестве исходной папки для обратного проектирования.

Статья ниже объясняет это подробно. https://knowhow.visual-paradigm.com/uml/why-arent-there-any-operations-to-choose-from-in-reverse-engineering-of-sequence-diagram/