Я хочу использовать DBSCAN из sklearn для поиска кластеров по моим позициям GPS. Я не понимаю, почему координата [ 18.28, 57.63] (нижний правый угол на рисунке) сгруппирована вместе с другими координатами слева. Может ли быть какая-то проблема с большим эпсилоном? sklearn версия 0.19.0. Чтобы воспроизвести это: я скопировал демонстрационный код отсюда: http://scikit-learn.org/stable/auto_examples/cluster/plot_dbscan.html, но я заменил образцы данных несколькими координатами (см. переменную X в коде ниже). Я черпал вдохновение отсюда: http://geoffboeing.com/2014/08/clustering-to-reduce-spatial-data-set-size/
import numpy as np
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn import metrics
from sklearn.datasets.samples_generator import make_blobs
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# #############################################################################
# Generate sample data
X = np.array([[ 11.95, 57.70],
[ 16.28, 57.63],
[ 16.27, 57.63],
[ 16.28, 57.66],
[ 11.95, 57.63],
[ 12.95, 57.63],
[ 18.28, 57.63],
[ 11.97, 57.70]])
# #############################################################################
# Compute DBSCAN
kms_per_radian = 6371.0088
epsilon = 400 / kms_per_radian
db = DBSCAN(eps=epsilon, min_samples=2, algorithm='ball_tree', metric='haversine').fit(X)
core_samples_mask = np.zeros_like(db.labels_, dtype=bool)
core_samples_mask[db.core_sample_indices_] = True
labels = db.labels_
# Number of clusters in labels, ignoring noise if present.
n_clusters_ = len(set(labels)) - (1 if -1 in labels else 0)
print('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
# #############################################################################
# Plot result
import matplotlib.pyplot as plt
# Black removed and is used for noise instead.
unique_labels = set(labels)
colors = [plt.cm.Spectral(each)
for each in np.linspace(0, 1, len(unique_labels))]
for k, col in zip(unique_labels, colors):
if k == -1:
# Black used for noise.
col = [0, 0, 0, 1]
class_member_mask = (labels == k)
xy = X[class_member_mask & core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=14)
xy = X[class_member_mask & ~core_samples_mask]
plt.plot(xy[:, 0], xy[:, 1], 'o', markerfacecolor=tuple(col),
markeredgecolor='k', markersize=6)
plt.title('Estimated number of clusters: %d' % n_clusters_)
plt.show()