java.lang.UnsatisfiedLinkError: нет GurobiJni / Tomcat

Мы пытаемся запустить Gurobi через веб-приложение Java с сервером Tomcat в CentOS. Системные переменные определены:

declare -x GRB_LICENSE_FILE="/home/suporte/gurobi.lic"
declare -x GUROBI_HOME="/opt/gurobi752/linux64"
declare -x LD_LIBRARY_PATH="\${LD_LIBRARY_PATH}:\${GUROBI_HOME}/lib"
declare -x PATH="/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:\$JAVA_HOME/bin:\$GUROBI_HOME/bin"

Гуроби и Ява нормально работают. Приложение отлично работает и в Tomcat, но когда оно вызывает Gurobi, мы получаем исключение: «java.lang.UnsatisfiedLinkError: no GurobiJni75 in java.library.path».

Exception in thread "Thread-14" java.lang.UnsatisfiedLinkError: no GurobiJni75 in java.library.path
    at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(ClassLoader.java:1867)
    at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Runtime.java:870)
    at java.lang.System.loadLibrary(System.java:1122)
    at gurobi.GurobiJni.<clinit>(GurobiJni.java:243)
    at gurobi.GRBEnv.<init>(GRBEnv.java:41)
    at gurobi.GRBEnv.<init>(GRBEnv.java:31)
    at br.com.lapin.otimizacao.model.ModelCorteGurobi.<init>(ModelCorteGurobi.java:43)

Есть идеи решить проблему?

Вот результат скрипта ...

Есть идеи решить проблему?


java centos tomcat gurobi unsatisfiedlinkerror
person Napoleao Nepomuceno    schedule 22.03.2018    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
1
arrow_downward

Вы можете установить LD_LIBRARY_PATH так, чтобы он указывал на каталог Gurobi, где хранятся файлы .so, а также на каталог, в котором хранятся файлы .jar.

Вы также можете сделать файл Gurobi jar доступным из Tomcat, скопировав или связав его.

Изменить 1

ln -sv $GUROBI_HOME/lib/gurobi.jar $TOMCAT_HOME/lib/

пытаться

вместо того

declare -x LD_LIBRARY_PATH="${LD_LIBRARY_PATH}:${GUROBI_HOME}/lib"

Произошла ошибка при использовании \, и вы не скопировали / вставили официальный документ.

declare -x LD_LIBRARY_PATH="\${LD_LIBRARY_PATH}:\${GUROBI_HOME}/lib"

Для дальнейшей отладки создайте JSP с этим содержимым, он отображает все свойства системы, и мы увидим java.library.path. Странно, что никто раньше этого не публиковал.

Изменить 2

<%@ page import="java.util.Properties" %>
<%@ page import="java.util.Set" %>

<%
Properties p = System.getProperties();

Set<String> keys = p.stringPropertyNames();
for (String key : keys)
  out.println(key + " : " + p.getProperty(key));

%>

Из вашего отладочного JSP мы видим, что ld.library.path правильно указывает на ваш каталог GUROBI lib. Мы можем попробовать добавить системное свойство для java.library.path. В вашей установке Tomcat отредактируйте или создайте bin/setenv.sh файл с таким содержимым:

Объяснение этого предложения можно прочитать здесь.

CATALINA_OPTS="-Djava.library.path=/opt/gurobi752/linux64/lib/"

кстати, я не знаю, куда вы положили свой declare -x, но было бы законно хранить их в bin / setenv.sh

Пожалуйста, дайте результат предоставленного мной JSP. Я хочу сам увидеть системные переменные, поскольку вашу проблему почти не нужно решать, и я написал аналогичное руководство по интеграции R + Tomcat.

person Eugène Adell    schedule 22.03.2018
comment
Я очень благодарен. К вопросу добавлен вывод сценария. - person Eugène Adell; 27.03.2018
comment
Форматирование нехорошее, но в любом случае мы видим, что ld.library.path правильно указывает на ваш каталог lib. И последнее, что нужно попробовать, это java.library.path, я редактирую свой ответ для этого, он более читабелен, чем комментарий. - person Napoleao Nepomuceno; 28.03.2018
comment
Привет, Эжен, сработало! Ваша помощь очень ценится. - person Eugène Adell; 28.03.2018
comment
Это хорошие новости @NapoleaoNepomuceno. Было приятно помочь и исследовать это странное поведение. - person Napoleao Nepomuceno; 28.03.2018
comment
java.vendor: Oracle Corporation sun.java.launcher: SUN_STANDARD catalina.base: / opt / tomcat sun.management.compiler: 64-разрядные многоуровневые компиляторы HotSpot catalina.use Имя: trueos.name: Linux sun.boot.class.path: /usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64/jre/lib/resources.jar:/usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk- 1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64 / jre / lib / rt.jar: /usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64/jre/lib /sunrsasign.jar:/usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64/jre/lib/jsse.jar:/usr/lib/jvm/java-1.8 .0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64 / jre / lib / jce.jar: /usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4. x86_64 / jre / lib / charsets.jar: /usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64/jre/lib/jfr.jar: / usr / lib / jvm / java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64 / jre / classes java.util.logging.config.file: /opt/tomcat/conf/logging.properties java.vm.specification Производитель: Oracle Corporation java.runtime. версия: 1.8.0_161-b14 имя пользователя: tomcat tomcat.util.scan.StandardJarScanFilter.jarsToScan: log4j-web * .jar, log4j-taglib * .jar, log4javascript * .jar, slf4j-taglib * .jar shared.loader: tomcat.util.buf. StringCache.byte.enabled: true user.language: en java.naming.factory.initial: org.apache.naming.java.javaURLContextFactory sun.boot.library.path: /usr/lib/jvm/java-1.8.0- openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64 / jre / lib / amd64 jdk.tls.ephemeralDHKeySize: 2048 java.version: 1.8.0_161 java.util.logging.manager: org.apache.juli.ClassLoaderLogManager user. часовой пояс: Etc / UTC sun.arch.data.model: 64 java.util.concurrent.ForkJoinPool.common.threadFactory: org.apache.catalina.startup.SafeForkJoinWorkerThreadFactory java.endorsed.dirs: / usr / lib / jvm / java 1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64 / jre / lib / endorsed sun.cpu.isalist: sun.jnu.encoding: UTF-8 file.encoding.pkg: sun.io package.access : sun., org.apache.catalina., org.apache.coyote., org.apache.jasper., org.apache.tomcat. file.separator: /java.specification.name: Спецификация API платформы Java java.class.version: 52.0 user.country: США java.home: /usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161- 0.b14.el7_4.x86_64 / jrejava.vm.info: смешанный режим os.version: 3.10.0-693.17.1.el7.x86_64 path.separator:: java.vm.version: 25.161-b14 java.protocol.handler .pkgs: org.apache.catalina.webresources java.awt.printerjob: sun.print.PSPrinterJob sun.io.unicode.encoding: UnicodeLittle awt.toolkit: sun.awt.X11.XToolkit package.definition: sun. , java., org.apache.catalina., org.apache.coyote., org.apache.jasper., org.apache.naming., org.apache.tomcat. java.naming.factory.url.pkgs: org.apache.naming java.security.egd: file: / dev /./ urandom user.home: / opt / tomcat java.specification.vendor: Oracle Corporation tomcat.util.scan .StandardJarScanFilter.jarsToSkip: bootstrap.jar, commons-daemon.jar, tomcat-juli.jar, annotations-api.jar, el-api.jar, jsp-api.jar, servlet-api.jar, websocket-api.jar , jaspic-api.jar, catalina.jar, catalina-ant.jar, catalina-ha.jar, catalina-storeconfig.jar, catalina-tribes.jar, jasper.jar, jasper-el.jar, ecj- .jar, tomcat-api.jar, tomcat-util.jar, tomcat-util-scan.jar, tomcat-coyote.jar, tomcat-dbcp.jar, tomcat-jni.jar, tomcat-websocket.jar, tomcat-i18n -en.jar, tomcat-i18n-es.jar, tomcat-i18n-fr.jar, tomcat-i18n-ja.jar, tomcat-juli-adapters.jar, catalina-jmx-remote.jar, catalina-ws.jar , tomcat-jdbc.jar, tools.jar, commons-beanutils .jar, commons-codec * .jar, commons-collections * .jar, commons-dbcp * .jar, commons-digester * .jar, commons -fileupload * .jar, commons-httpclient * .jar, commons-io * .jar, commons-lang * .jar, commons-logging * .jar, commons-math * .j ar, commons-pool * .jar, jstl.jar, taglibs-standard-spec- .jar, geronimo-spec-jaxrpc .jar, wsdl4j * .jar, ant.jar, ant-junit * .jar, aspectj * .jar, jmx.jar, h2 * .jar, hibernate * .jar, httpclient * .jar, jmx-tools.jar, jta * .jar, log4j * .jar, mail * .jar, slf4j * .jar, xercesImpl.jar, xmlParserAPIs.jar, xml-apis.jar, junit.jar, junit- .jar, hamcrest- .jar, easymock- .jar, cglib - .jar, objenesis- .jar, ant-launcher.jar, cobertura- .jar, asm- .jar, dom4j- .jar, icu4j- .jar, jaxen- .jar, jdom- .jar, jetty- .jar, oro- .jar, servlet-api- .jar, tagsoup- .jar, xmlParserAPIs- .jar, xom- .jar java.library.path: / usr / java / packages / lib / amd64: / usr / lib64: / lib64: / lib: / usr / lib java.vendor.url: http://java.oracle.com/ ld.library .path: / opt / gurobi752 / linux64 / lib / java.vm. поставщик: Oracle Corporation common.loader: "$ {catalina.base} / lib", "$ {catalina.base} / lib /. jar "," $ {catalina.home} / lib "," $ {catalina.home} / lib / *. jar "," / usr / lo cal / gurobi605 / linux64 "java.runtime.name: Среда выполнения OpenJDK sun.java.command: org.apache.catalina.startup.Bootstrap start java.class.path: /opt/tomcat/bin/bootstrap.jar:/opt /tomcat/bin/tomcat-juli.jarjava.vm.specification.name: Спецификация виртуальной машины Java java.vm.specification.version: 1.8 catalina.home: / opt / tomcat sun.cpu.endian: little sun.os.patch .level: unknown java.awt.headless: true java.io.tmpdir: / opt / tomcat / temp java.vendor.url.bug: http://bugreport.sun.com/bugreport/ server.loader: "/opt/gurobi752/linux64/lib/gurobi.jar" os.arch: amd64 java.awt.graphicsenv : sun.awt. X11GraphicsEnvironment java.ext.dirs: /usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-1.8.0.161-0.b14.el7_4.x86_64/jre/lib/ext:/usr/java/packages/lib/ext user.dir: / line.separator: java.vm.name: 64-разрядная серверная виртуальная машина OpenJDK ignore.endorsed.dirs: file.encoding: UTF-8 java.specification.version: 1.8 - person Eugène Adell; 28.03.2018