Я пытался загрузить некоторые данные ГИС из базы данных PostGIS в Cytoscape 3.6. Я пытаюсь получить некоторые значения inDegree и outDegree. Я использовал формат файла sif.
Если данные записаны в следующем формате
source_point \ tin взаимодействует с \ ttarget_point
Cytoscape рада это прочитать.
Мне просто интересно, есть ли способ включить мою собственную метрику для стоимости перехода между source_point и target_point
Конечно! Есть несколько способов чтения текстовых файлов в Cytoscape - SIF - лишь один из них. Я бы создал файл, который выглядит как SIF, но на самом деле является более полным текстовым файлом:
Source\tTarget\tScore
source_point\ttarget_point\t1.1
...
Затем используйте «Файл-> Импортировать сеть-> Файл», выберите источник и цель и оставьте оценку в качестве атрибута края. Вы можете иметь столько атрибутов в каждой строке, сколько хотите, и даже можете смешивать атрибуты ребер, атрибуты исходного узла и атрибуты целевого узла.
-- самокат
