Ошибка обработки TypeError: ожидаемый кортеж, str загружает CSV в многоуровневые и многоиндексные pandas (pandas)

Я пытаюсь загрузить файл CSV (этот файл) для создания многоиндексного многоуровневого фрейма данных. Он имеет 5 (пять) индексов и 3 (три) уровня в столбцах.

Как я могу сделать? Вот код:

df = pd.read_csv('./teste.csv'
                  ,index_col=[0,1,2,3,4]
                  ,header=[0,1,2,3]
                  ,skipinitialspace=True
                  ,tupleize_cols=True)

df.columns = pd.MultiIndex.from_tuples(df.columns)

Ожидаемый результат:

variables                                                u                  \
level                                                    1                   
days                                                     1               2   
times                                                  00h 06h 12h 18h 00h   
wsid lat        lon        start               prcp_24                       
329  -43.969397 -19.883945 2007-03-18 10:00:00 72.0      0   0   0   0   0   
                           2007-03-20 10:00:00 104.4     0   0   0   0   0   
                           2007-10-18 23:00:00 92.8      0   0   0   0   0   
                           2007-12-21 00:00:00 60.4      0   0   0   0   0   
                           2008-01-19 18:00:00 53.0      0   0   0   0   0   
                           2008-04-05 01:00:00 80.8      0   0   0   0   0   
                           2008-10-31 17:00:00 101.8     0   0   0   0   0   
                           2008-11-01 04:00:00 82.0      0   0   0   0   0   
                           2008-12-29 00:00:00 57.8      0   0   0   0   0   
                           2009-03-28 10:00:00 72.4      0   0   0   0   0   
                           2009-10-07 02:00:00 57.8      0   0   0   0   0   
                           2009-10-08 00:00:00 83.8      0   0   0   0   0   
                           2009-11-28 16:00:00 84.4      0   0   0   0   0   
                           2009-12-18 04:00:00 51.8      0   0   0   0   0   
                           2009-12-28 00:00:00 96.4      0   0   0   0   0   
                           2010-01-06 05:00:00 74.2      0   0   0   0   0   
                           2011-12-18 00:00:00 113.6     0   0   0   0   0   
                           2011-12-19 00:00:00 90.6      0   0   0   0   0   
                           2012-11-15 07:00:00 85.8      0   0   0   0   0   
                           2013-10-17 00:00:00 52.4      0   0   0   0   0   
                           2014-04-01 22:00:00 72.0      0   0   0   0   0   
                           2014-10-20 06:00:00 56.6      0   0   0   0   0   
                           2014-12-13 09:00:00 104.4     0   0   0   0   0   
                           2015-02-09 00:00:00 62.0      0   0   0   0   0   
                           2015-02-16 19:00:00 56.8      0   0   0   0   0   
                           2015-05-06 17:00:00 50.8      0   0   0   0   0   
                           2016-02-26 00:00:00 52.2      0   0   0   0   0

Мне нужна ошибка обработки "TypeError: Ожидаемый кортеж, получена строка":

TypeError: Expected tuple, got str

python pandas csv multi-level
person Andre Araujo    schedule 27.10.2018    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
3
arrow_downward

Вы получаете сообщение об ошибке, потому что некоторые из ваших столбцов не являются кортежами, это строки от индекса 2368 до 2959 в df.columns.
Индексы, где столбцы являются строками:

df.columns[2368:2959]
Index(['('z', '1', '1', '00h').1', '('z', '1', '1', '06h').1',
       '('z', '1', '1', '12h').1', '('z', '1', '1', '18h').1',
       '('z', '1', '2', '00h').1', '('z', '1', '2', '06h').1',
       '('z', '1', '2', '12h').1', '('z', '1', '2', '18h').1',
       '('z', '1', '3', '00h').1', '('z', '1', '3', '06h').1',
       ...
       '('z', '1000', '2', '06h').1', '('z', '1000', '2', '12h').1',
       '('z', '1000', '2', '18h').1', '('z', '1000', '3', '00h').1',
       '('z', '1000', '3', '06h').1', '('z', '1000', '3', '12h').1',
       '('z', '1000', '3', '18h').1', '('z', '1000', '4', '00h').1',
       '('z', '1000', '4', '06h').1', '('z', '1000', '4', '12h').1'],
      dtype='object', length=591)

Поскольку вам нужен фрейм данных столбца с несколькими индексами, использующий кортежи, поэтому мы сначала очищаем эти строки, беря подстроку, которая необходима, используя re.findall с regex pattern = '(\(.*?\)).', а затем передавая это значение через ast.literal_eval для автоматического преобразования строки в кортеж. Наконец, используя pd.MultiIndex.from_tuples как:

df = pd.read_csv('teste.csv',index_col=[0,1,2,3,4],header=[0,1,2,3],parse_dates=True)

import re
import ast

column_list = []
for column in df.columns:
    if isinstance(column,str):
        column_list.append(ast.literal_eval(re.findall('(\(.*?\)).',column)[0]))
    else:
        column_list.append(column)


df.columns = pd.MultiIndex.from_tuples(column_list,
                                       names=('variables', 'level','days','times'))

print(df.iloc[:,:6].head())
variables                                                u                    
level                                                    1                    
days                                                     1               2    
times                                                  00h 06h 12h 18h 00h 06h
wsid lat        lon        start               prcp_24                        
329  -43.969397 -19.883945 2007-03-18 10:00:00 72.0      0   0   0   0   0   0
                           2007-03-20 10:00:00 104.4     0   0   0   0   0   0
                           2007-10-18 23:00:00 92.8      0   0   0   0   0   0
                           2007-12-21 00:00:00 60.4      0   0   0   0   0   0
                           2008-01-19 18:00:00 53.0      0   0   0   0   0   0
person Space Impact    schedule 27.10.2018