Точная замена строки (предложения или слова) в длинном файле

Я хотел бы заменить предложения кодом в большом файле. Я пытался использовать str_replace, но поскольку в файле есть некоторые из тех же слов предложения, мой код заменяет их и не распознает предложение!

<?php
// sentences,txt
// 12345Temple of Cheope
// ..........
// 99999Cheope

set_time_limit(0);
$GetCodice=@fopen("sentences.txt", "r");
if ($GetCodice) {
while(!feof($GetCodice)) {
    $StoreCodice=fgets($GetCodice,4096);
    $codice='".'.substr($StoreCodice, 0, 6).'."';  // abcd
    $msg=trim(substr($StoreCodice, 6));  // abcd
    echo $msg."<br>";
    $n=0;
            $file = 'longfile.php';
            replace_file($file, $msg, $codice);
   }
   fclose($GetCodice);
}

// From https://stackoverflow.com/questions/2159059/string-replace-in-a-large-file-with-php
function replace_file($path,$string, $replace)
{
    set_time_limit(0);

    if (is_file($path) === true) 
    {
        $file = fopen($path, 'r');
        $temp = tempnam('./', 'tmp');

        if (is_resource($file) === true)
        {
            while (feof($file) === false)
            {
            file_put_contents($temp, str_replace($string, $replace, fgets($file)), FILE_APPEND);
            }

            fclose($file);
        }
        unlink($path);
    }
    echo $replace."<BR>";
     return rename($temp, $path);
}           
?>

Предложения упорядочены по убыванию их длины. Я думал, что этот порядок позволит избежать замены более короткого предложения или слова в более длинном предложении. Я ожидаю выхода

12345
.....
99999

но фактический результат

Temple of 9999
.....
99999

Могу ли я получить некоторую помощь?

заранее спасибо