Сохраненное значение исчезает при установке указателя структуры на null в C++

Проблема, вероятно, в том, что в cleanse вы возвращаете clean.c_str().

Это значение указателя перестает быть действительным, когда clean перестает существовать, то есть когда функция завершает работу. Больше не гарантируется, что он указывает на что-либо, так что это чистая удача, что вы когда-либо видите строку «снова», как и ожидалось.

Я подозреваю, что происходит то, что память, которая используется для хранения данных для строки clean в cleanse, была повторно использована для структуры word, но не перезаписывается немедленно. Так уж получилось, что байт, который раньше содержал первый a, теперь содержит часть same члена вашей структуры. Таким образом, когда вы записываете нулевой указатель на node->same, это приводит к записи 0 байтов в место, на которое указывает node->clean. После этого он указывает на пустую строку.

Вам нужно сократить свой код до минимального примера, отображающего проблему, и опубликовать его.

Следующий код не отображает проблему. Содержимое main и определение Word скопированы из вашего кода, затем я добавил код, необходимый для его компиляции:

#include <iostream>
#include <cstring>
using namespace std;

typedef int SongId;

struct Word{
    char* clean;
    int size;
    int position;
    SongId id;
    Word* same;
    Word* diff;
};

char *cleanse(const char *w) {
    return (char *)w;
}
const char *word = "again ";
const int position = 1739;
const int id = 0;

int main() {
    char* clean = cleanse(word);
    Word* node = new Word;
    node->size = strlen(word);
    node->clean = clean;
    cout<<"MADE NODE FOR "<<node->clean<<endl;
    node->position = position;
    cout<<"4 node clean: "<<node->clean<<endl;
    node->id = id;
    cout<<"5 node clean: "<<node->clean<<endl;
    node->same = NULL;
    cout<<"6 node clean: "<<node->clean<<endl;
    cout<<"node position: "<<node->position<<endl;
    cout<<"node size: "<<node->size<<endl;
    node->diff = NULL;
}

Выход:

MADE NODE FOR again 
4 node clean: again 
5 node clean: again 
6 node clean: again 
node position: 1739
node size: 6

Хорошо, нам нужно увидеть код для некоторых из них, чтобы быть уверенным, но вот что говорит вам ошибка: в какой-то момент вы назначаете что-то, что перезаписывает или удаляет ваш clean. Поскольку вы объявляете его как char *, я предполагаю, что вы используете его как указатель на массив символов, и велика вероятность, что один массив совмещен с двумя «чистыми» указателями в двух разных словах.

Помимо new и cout, это также может быть C.

Некоторое другое чтение
Каковы различия между структурой и класс на C++?
char * Vs std::string
Удалить пробелы из std:: строка в C++
функция tolower для строк C++
Как отменить функтор в C++ (STL)?

#include <iostream>
#include <string>
#include <algorithm>
#include <functional>

typedef int SongId;

class Word{
    int position;
    SongId id;
    Word* same;
    Word* diff;

public: 
  const std::string word;

  const int size() const { return clean.length() };

  Word( const std::string& word_, const int position_ = 1739, const int id_ = 0 )
    : clean( cleanse(word_) )
    , position( position_ )
    , id( id_ )
    , same( NULL )
    , diff( NULL )
  {
    cout<<"MADE NODE FOR "<< word_ << "\n"
      <<"node clean: "<< word << "\n"
      <<"node position: "<< position << "\n";
      <<"node size: "<< size() << endl;
  }

  static std::string cleanse( const std::string& dirty)
  {
    string clean( dirty );

// Remove anything thats not alpha num
    clean.erase(remove_if(clean.begin(), clean.end(), std::not1(::isalnum) ), clean.end());
// make it lower case
    std::transform( clean.begin(), clean.end(), clean.begin(), ::tolower);  // or boost::to_lower(str);

    return clean;
  }
};

const char *word = "again ";

int main() {
    Word* node = new Word(word);
}