Я объединил 190 сетей, полученных от KEGG, с помощью Cytoscape. Объединенная сеть имеет узел, называемый «контейнером», который очень сильно связан с несколькими другими узлами. «Контейнер» узла не происходит из исходных файлов пути. Что представляет собой этот узел и каково его значение? 
Что такое «контейнерный» узел при слиянии нескольких сетей в Cytoscape?
Ответы (1)
Я почти уверен, что это тоже не из инструмента слияния Cytoscape. Я предполагаю, что некоторые из ваших путей имеют узлы-контейнеры, которые охватывают комплекс или группу генов. Во время слияния все они станут одним и тем же узлом. Даже если вы не видите узел «контейнер» в сетевом представлении, проверьте, появляется ли он где-нибудь в таблице узлов.
-- самокат
person
Scooter Morris
schedule
05.03.2020
Большое спасибо за Ваш ответ. Я вгляделся в это более глубоко, и вы правы. Некоторые белки сгруппированы в «контейнер», и при их объединении разные «групповые узлы» считаются одним целым.
- person Sara Ibrahim Omar; 06.03.2020
