Как сгенерировать марковскую матрицу из приведенного ниже графика?

Я использую программное обеспечение CytoScape. У него есть возможность автоматически создавать кластер MCL, но у меня возникают трудности с просмотром связанной матрицы. Кто-нибудь знает, как получить это с помощью Cytospace?

кластер mcl, сгенерированный с помощью clustermaker2


person dp758    schedule 18.10.2020    source источник


Ответы (1)


Приложение clusterMaker2 для Cytoscape выполняет кластеризацию MCL, но не предоставляет выходные данные для промежуточных шагов, таких как начальная матрица сети. Однако существует приложение для Cytoscape, которое может экспортировать матричную версию любой заданной сети: http://apps.cytoscape.org/apps/adjexporter.

person AlexanderPico    schedule 22.10.2020