Странная ошибка времени выполнения (ClassCastException при объявлении)

Вам не хватает кода, который инициализирует T, но я предполагаю, что он выглядит примерно так. Я добавил несколько строк, которые не меняют никакой функциональности, но помогут продемонстрировать ошибку:

public class Clazz<T> {
    T[] t = (T[]) new Object[5];

    public Clazz<T> methodA(int... ints) {
        Clazz<Integer> ints2 = new Clazz<Integer>();
        int l1 = t.length;
        int l2 = ints2.t.length;
        int remInd[] = new int[l1 - l2];
        return this;
    }

    public static void main(String...args) {
        Clazz<String> clazz = new Clazz<String>();
        clazz.methodA(54, 7);
    }
}

С помощью этого кода я смог воспроизвести ошибку. Проблема здесь в этом коде:

int l2 = ints2.t.length

Поскольку компилятор знает параметр типа для ints2 и, следовательно, ints2.t, это можно рассматривать как грубый эквивалент этого:

Integer[] temp = ints2.t;
int l2 = temp.length;

Именно в неявном приведении к Integer[] (простое имя которого [Ljava.lang.Integer) это терпит неудачу, поскольку t является Object[], а не Integer[], и одно нельзя привести к другому.

Работа с универсальными массивами

Есть много сложностей при работе с массивами, объявленными поверх универсального типа, которые описаны в других источниках. Вкратце, я скажу, что если вам нужен «общий массив», вместо этого рассмотрите возможность объявления и использования его как Object[] любым способом, кроме того, что когда вы взаимодействуете с клиентом класса, вы либо принимаете, либо возвращаете только T вместо Object (для возврата через непроверенное приведение). Например,

Object[] t = new Object[5];

public T getSomethingFromArray() {
    return (T)t[2];
}

public void setSomethingInArray(T something) {
    t[2] = something;
}

Кстати, так работает ArrayList. Взгляните на его код в DocJar.

Редактировать

Помимо общих массивов, я не думаю, что вы понимаете идею неявного приведения типов. Вот гораздо более короткий код, который завершается практически с той же ошибкой:

public class Clazz<T> {
    T t = (T) new Object();

    public static void main(String...args) {
        Clazz<String> clazz = new Clazz<String>();
        clazz.t.toString();
    }
}

Exception in thread "main" java.lang.ClassCastException: java.lang.Object cannot be cast to java.lang.String
    at Clazz.main(Clazz.java:6)
    ...

Несмотря на то, что нет необходимости приводить clazz.t к строке, это делается неявно, просто путем ссылки на clazz.t. Вот вывод javap -c для этого скомпилированного класса:

Compiled from "Clazz.java"
public class Clazz extends java.lang.Object{
java.lang.Object t;

public Clazz();
  Code:
   0:   aload_0
   1:   invokespecial   #1; //Method java/lang/Object."<init>":()V
   4:   aload_0
   5:   new #2; //class java/lang/Object
   8:   dup
   9:   invokespecial   #1; //Method java/lang/Object."<init>":()V
   12:  putfield    #3; //Field t:Ljava/lang/Object;
   15:  return

public static void main(java.lang.String[]);
  Code:
   0:   new #4; //class Clazz
   3:   dup
   4:   invokespecial   #5; //Method "<init>":()V
   7:   astore_1
   8:   aload_1
   9:   getfield    #3; //Field t:Ljava/lang/Object;
//BELOW is the line that will fail
   12:  checkcast   #6; //class java/lang/String
   15:  invokevirtual   #7; //Method java/lang/String.toString:()Ljava/lang/String;
   18:  pop
   19:  return

}

В случае вашего исходного кода, вот вывод javap -c methodA():

public Clazz methodA(int[]);
  Code:
   0:   new #5; //class Clazz
   3:   dup
   4:   invokespecial   #6; //Method "<init>":()V
   7:   astore_2
   8:   aload_0
   9:   getfield    #4; //Field t:[Ljava/lang/Object;
   12:  arraylength
   13:  aload_2
   14:  getfield    #4; //Field t:[Ljava/lang/Object;
//BELOW is the line that will fail
   17:  checkcast   #7; //class "[Ljava/lang/Integer;"
   20:  arraylength
   21:  isub
   22:  newarray int
   24:  astore_3
   25:  aload_0
   26:  areturn