Я загружаю пути с WikiPathways, чтобы визуализировать данные об экспрессии белка. Некоторые пути загружаются нормально, однако некоторые (включая WP2572, WP51, WP306) не имеют аннотаций узлов. Я ничего не делаю по-другому при их загрузке, кто-нибудь может предложить решение?
Половина путей, которые я пытаюсь загрузить, не имеют аннотаций узлов.
Ответы (1)
Можете ли вы сказать нам, какую версию Cytoscape и какую версию приложения wikipathways вы используете? Я только что импортировал WP2572, и он отлично смотрится на моей машине. Вы также можете убедиться, что таблица стилей имеет правильное сопоставление — это должно быть сквозное сопоставление с именем.
-- самокат
person
Scooter Morris
schedule
04.02.2021
Спасибо за ваш ответ! Я использую версию 3.8.2 цитоскейпа и wikipathways 3.3.7, и все настройки таблицы стилей кажутся правильными.
- person Catherine Shelton; 09.02.2021