Позвольте мне начать с того, что я не очень опытный программист и был бы очень признателен, если бы вы могли полностью указать любые шаги, которые вы могли бы пропустить.
В настоящее время я нахожусь на начальных этапах разработки плагина для Cytoscape, я создал java-проект в Eclipse и сделал следующее.
Я добавил Cytoscape.jar в качестве внешней библиотеки.
Я добавил "-p C:\Program Files\Cytoscape_v2.8.1\plugins" на вкладке аргументов в разделе "Аргументы программы"
Когда я пытаюсь запустить плагин, он загружает цитоскейп, но без каких-либо установленных плагинов (0 плагинов в диспетчере плагинов), кроме того, он также имеет урезанные параметры меню (не может импортировать определенные файлы, параметров просто больше нет)
Я подозреваю, что это потому, что мне нужно включить больше файлов jar в качестве внешних библиотек, однако я не уверен, какие именно.
Я использую Eclipse Indigo и Cytoscape 2.8.1.
Я не думаю, что это проблема с кодом плагина, так как я использовал исходный код из существующего плагина в качестве тестового плагина.
Спасибо за ваше терпение и время.
Судипто
PS: я уже просмотрел следующее без особого успеха http://cytoscape.wodaklab.org/wiki/SettingUpEclipseForPluginDevelopment