Возможно, это связано с этим вопросом, но у меня немного больше информации.
Недавно я обновил приложение ASP.Net до .NET 3.5 после написания нескольких новых фрагментов с помощью Linq. Теперь мои страницы периодически перестают запускать обработчики событий. Я сузил его до страниц с Ajax на них, и я предполагаю, что это либо регистрация ScriptManager, либо регистрация AjaxControlToolkit, которая ускоряет проблему.
Действительно странная часть заключается в том, что страницы, кажется, работают нормально примерно в 2/3 случаев, а элементы управления теряют свои обработчики событий только в 1/3 случаев. Я задавался вопросом о возникновении какой-либо ошибки и неправильном отображении страницы, но я не могу найти доказательств этого.