Я пытаюсь использовать команду выделения ресурсов памяти, доступную в LSF. Обычный формат команды: bsub -R "rusage [mem=1000]" сон 100 с Когда я запускаю эту команду прямо из терминала, она работает. Когда я запускаю эту команду из...

когда я делал расчет на полпути, я просто обнаружил, что ограничение времени выполнения 50:00 может быть недостаточным. Поэтому я использую $bstop 1234, чтобы остановить задание 1234 и попытаться изменить старую среду выполнения с -W 50:00 на -W...

Могу ли я отправлять "однострочные" сообщения в SLURM? Используя bsub из LSF и стандартную утилиту Linux xargs , я могу легко отправить отдельное задание для распаковки всех файлов в каталоге: ls *.gz | sed 's/.gz$//g' | xargs -I {} bsub...

Я ищу некоторые общие советы, а не решение для кодирования. В основном при отправке задания через bsub я могу получить журнал Stdin/Stdout, указав любое из следующего: bsub -o log.txt % sends StdOut to log.txt bsub -u me@email % sends...

Я запускаю массив заданий LSF для создания цели в make-файле. Однако, как только массив отправлен, make считает, что команда для цели должна быть выполнена, и выдает ошибку, поскольку цель не существует. Как я могу заставить make дождаться...

У меня есть несколько машин RHEL7, которые являются частью кластера GPFS, и когда память исчерпывается, демон GPFS и драйверы аварийно завершают работу файловых систем, которыми они управляют. Есть 3 иерархии памяти cgroup, которые я хочу...

Мне интересно, есть ли способ ограничить отправку задания в зависимости от места, где представление было сделано в HPC. Дело в том, что недавно было добавлено хранилище для рабочего диска. Итак, теперь у меня есть два раздела. домашний...

Я хотел бы использовать snakemake с LSF. Я следую этот URL . Мой файл Snakefile содержит: rule all: input: "foo.txt", "file.out" rule foo: input: "foo.txt" output: "bar.txt" shell: "set +o pipefail; grep bar...

Итак, я работаю в кластере Linux с большим количеством вычислительных узлов на выбор. Я получаю эксклюзивное право на использование узла. Пакетные подачи. Я сталкиваюсь с проблемами, ограничивающими количество потоков. Я должен упомянуть, что у...