Я пытаюсь извлечь только первое попадание из файла NCBI xml BLAST. далее я хотел бы получить только первый HSP. на финальном этапе я хотел бы получить их на основе лучшего результата. чтобы прояснить здесь пример файла xml: <?xml...

Возможные дубликаты: выбор значения атрибута в SimpleXML SimpleXML: выбор элементов, имеющих определенное значение атрибута Я анализирую XML-документ и ищу определенный идентификатор. Значение идентификатора указывается в элементе...

Я пытаюсь взорвать последовательность нуклеотидов, используя NCBIWWW from Bio.Blast import NCBIWWW my_query = "TGCGTGCCGTGCAATGTGCGT" result_handle = NCBIWWW.qblast("blastn", "nt", my_query) blast_result = open("my_blast.xml", "w")...

Я пытаюсь загрузить nr blastdabase с ftp-сайта NCBI ( ftp: // ftp. ncbi.nlm.nih.gov/blast/db ). Один из файлов довольно большой (16 ГБ), и его загрузка занимает некоторое время. По окончании загрузки этого файла программа просто зависает, не...