Автоматически ли ITK / SimpleITK обслуживает HU, используя пересечение масштабирования и наклон из метаданных для файлов Nifti, как это делается для файлов dicom ( source )? Если нет, как я могу прочитать метаданные в python 3.4? Я прошел через...

Я пытаюсь прочитать файл NIFTI внутри .zip без необходимости извлекать каталог в корневой каталог. В частности, я работаю с базой данных ADNI, и файлы хранятся по идентификатору субъекта в отдельных файлах .zip. Внутри файла .zip есть все данные,...

Я меняю размер вокселя некоторых трехмерных объемов. Как мне отредактировать поле pixdim и вычислить новое affine ? У меня есть некоторые объемы MR, которые являются анизотропными, размеры вокселей, скажем, 0.5 x 0.5 x 3 мм. И у меня есть...

Я знаю, что SimpleITK может читать 3D-изображения в формате Nifty (.nii), а также поддерживает сжатую версию nii.gz. Однако я не могу загрузить файлы nii.zip. Эти файлы выдают ошибку, если я пытаюсь разархивировать/распаковать их напрямую, а также...

У меня есть папка с файлами DICOM внутри (например, компьютерная томография), и мне нужно извлечь аффинную информацию об объеме, так как я создам маску, и она понадобится позже, чтобы выровнять объем и маску. Однако решение, которое у меня есть...

У меня есть более 200 файлов CT-Volume с соответствующими сегментами. Объемы представлены в формате .nrrd, а сегментации — в формате seg.nrrd. Мне нужны оба в формате .nii.gz, и я хочу написать сценарий преобразования из одного в другой формат....