Я знаю, как запустить bash-скрипт на Jenkins. Однако, если я использую qsub для отправки сценария bash в систему OGE, как Дженкинс узнает, завершена моя работа или нет?

Я хотел спросить о функции ожидания в drmaa API, которую я использую через Python. Выполняет ли он постоянный qstat (если мы запускаем его на SGE), чтобы проверить, завершилось ли выполнение программы. Наш администратор хочет, чтобы мы избегали...

Параметр -V с qusb импортирует только переменную среды, но не псевдоним из .bashrc . Например ### in .bashrc alias ll='ls -ltr' alias la='ls -A' export PYTHONPATH=/local/python_other:$PYTHONPATH и скрипт qsub #!/bin/sh #$ -V echo...

На справочной странице qstat (Sun Grid Engine): mem: Текущее накопленное использование памяти заданием в гигабайтах секунд. Что это значит?

У меня есть код Matlab, который запускает функции С++, он хорошо работает на моем компьютере или любом другом рабочем столе, на котором я пытался его запустить. (чтобы запустить его на другом рабочем столе, я скопировал функции Matlab/С++ и файлы...

Когда я qsub скрипт, который запускает java-программу, я получаю эту ошибку: Исключение в потоке «main» java.lang.UnsatisfiedLinkError: /usr/java/jdk1.6.0_16/jre/lib/amd64/xawt/libmawt.so: libXtst.so.6: невозможно открыть файл общего объекта:...

Я пытаюсь отправить задание в кластер [работает Sun Grid Engine (SGE)]. Работа продолжала завершаться со следующим отчетом: Job 780603 (temp_new) Aborted Exit Status = 137 Signal = KILL User = heaswara Queue...

Я пытаюсь использовать три сценария для запуска одной процедуры (программа в приведенном ниже коде) в «пакетном» режиме на удаленном сервере с SGE-фронтом. Однако по какой-то причине сервер дает мне трассировку, в которой говорится, что файл, который...

Мне интересно, можно ли создать виртуальный кластер с Docker, чтобы я мог запускать сценарии, разработанные для кластеров HPC, используя управление кластером SGE. Это довольно большие/сложные рабочие процессы, поэтому я не могу просто переписать их,...

Я хотел бы отправить задание исключительно на один узел в cfncluster, используя параметр qsub планировщика SGE. Кто-нибудь знает, как правильно зарезервировать или использовать полный экземпляр для задания в cfncluster. qsub -l hostname=node@123...

Я пытаюсь запустить параллельное задание MPI с помощью планировщика Sun Grid Engine в кластере Rocks v5.4.3. В кластере есть очередь с именем all.q, состоящая из 22 вычислительных узлов: 21 из которых имеет 8 ЦП, а 1 — 4 ЦП. Однако при выполнении...

Я хотел бы, чтобы snakemake запускал скрипт Python с определенной средой conda через кластер SGE. В кластере у меня в домашнем каталоге установлена ​​miniconda. Мой домашний каталог смонтирован через NFS, поэтому он доступен для всех узлов...

Можно ли каким-либо образом просмотреть историю завершенных заданий в Sun Grid Engine, qstat -j jobId может получить информацию о заданиях только в списке qstat. Если такой jobId не существует в его текущем списке вывода, он выведет Following jobs...

Мы создаем наше программное обеспечение на SGE, работающем на ведомых устройствах CentOS, и оно работает хорошо. Мой вопрос: как сообщить SGE, что задание занимает несколько ядер на данном подчиненном устройстве, запустив несколько процессов?...