Мне нужно нарисовать кривую ROC, используя предсказанные вероятности для задачи двух классов. Необходимо использовать различные отсечки вероятностей для построения ROC-кривой.
Я предсказываю вероятности класса, используя случайный лес
mydata<-read.table(file="out-all-gm-pr-hpcuts-wor-noAl.tr", header=TRUE, sep ="")
mydata$class <- as.factor(mydata$class)
mydata.rf<-randomForest(class ~ ., data=mydata, importance = TRUE, mtry = 3, ntree = 100, proximity = TRUE )
Прогноз на тестовых данных с использованием вышеуказанного леса
mytestdata<-read.table(file="gmsim-craboff.tes",header=TRUE)
testpred<-predict(mydata.rf,mytestdata,type='prob')
Теперь у меня есть файл данных с истинной меткой класса и прогнозируемыми вероятностями для тестовых данных. Мне нужно сгенерировать кривую ROC, используя разные значения отсечки (скажем, 0.1, 0.3, 0.5, 0.7, 0.9) в вероятностях. Как это сделать?
