Использование заголовка таблицы в файле уценки R с помощью knitr для использования в pandoc для преобразования в pdf

Если вы не настаиваете на использовании решения только для LaTeX / HTML с прекрасным пакетом xtable, вы можете добиться того же с помощью уценки Pandoc. Один из вариантов - добавить заголовок вручную под таблицей или использовать мой Пакет записи R Pandoc:

> library(pander)                         # load pkg
> panderOptions('table.split.table', Inf) # not to split table
> set.caption('Hello Fisher!')            # add caption
> pander(head(iris))                      # show (almost) any R object in markdown
-------------------------------------------------------------------
 Sepal.Length   Sepal.Width   Petal.Length   Petal.Width   Species 
-------------- ------------- -------------- ------------- ---------
     5.1            3.5           1.4            0.2       setosa  

     4.9            3.0           1.4            0.2       setosa  

     4.7            3.2           1.3            0.2       setosa  

     4.6            3.1           1.5            0.2       setosa  

     5.0            3.6           1.4            0.2       setosa  

     5.4            3.9           1.7            0.4       setosa  
-------------------------------------------------------------------

Table: Hello Fisher!

Затем используйте Pandoc для преобразования этого файла уценки в HTML, LaTeX, docx, odt или любые другие популярные форматы документов.

Вы можете вставлять таблицы с автоматически пронумерованными заголовками в markdown для обработки с помощью pandoc, используя прямой код knitr. Вставьте этот фрагмент кода в начало вашего файла .rmd:

```{r setup, echo=FALSE}
tn = local({
  i = 0
  function(x) {
    i <<- i + 1
    paste('\n\n:Table ', i, ': ', x, sep = '')
    # The : before Table tells pandoc to wrap your caption in <caption></caption>
  }
})
knit_hooks$set(tab.cap = function(before, options, envir) {
  if(!before)
    tn(options$tab.cap)
})
default_output_hook = knit_hooks$get("output")
knit_hooks$set(output = function(x, options) {
  if (is.null(options$tab.cap) == F)  
    x
  else
    default_output_hook(x,options)
})
```

Чтобы вставить заголовок пронумерованной таблицы:

```{r myirischunk, tab.cap="This is the head of the Iris table"}
kable(head(iris))
```

Переопределив обработчик вывода и используя tab.cap, вам не нужно загромождать параметры блока с помощью results = 'asis'.

Спасибо Knitr!

PS: Если вы хотите преобразовать в latex / pdf, вы, вероятно, захотите, чтобы латекс пронумеровал таблицы за вас. В этом случае вы можете изменить tn(options$tab.cap) на paste('\n\n:', options$tab.cap, sep=''), но я этого не проверял.

Вы можете сделать это с помощью xtable. Добавьте caption к xtable и comment=FALSE к функции print.

print(
  xtable(
    head(iris),
    caption = 'Iris data'
  ),
  comment = FALSE,
  type = 'latex'
)

См. xtable и print.xtable документация.

Я знаю, что это произошло много лет назад, но если кто-то вроде меня приехал сюда в поисках ответа, я скажу вам ответ, который я нашел для той же проблемы.

Это было действительно просто, нам просто нужно было поставить:

```{r mostrarSerie,results='asis',echo=FALSE}
library(xtable)
options(xtable.floating = TRUE)
print(xtable(AP, digits = 0,caption = "Serie de tiempo"),comment = FALSE)
```

Важный шаг - ввести параметры xtable.floating = TRUE, потому что так LaTeX распознает таблицу.