Я пытаюсь установить блестящий сервер R на моем локальном компьютере с Ubuntu 12.04 и следовал инструкциям здесь https://github.com/rstudio/shiny-server/wiki/Ubuntu-step-by-step.-install-instructions:
При попытке сделать:
install.packages('shiny', repos='http://cran.rstudio.com/')
Он проходит через зависимости, но не может установить Rcpp. Смотрите журнал ошибок ниже:
* installing *source* package 'Rcpp' ...
* package 'Rcpp' successfully unpacked and MD5 sums checked
* libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c Date.cpp -o Date.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c Module.cpp -o Module.o
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c Rcpp_init.c -o Rcpp_init.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c Timer.cpp -o Timer.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c api.cpp -o api.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c attributes.cpp -o attributes.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c barrier.cpp -o barrier.o
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I../inst/include/ -fpic -O3 -pipe -g -c exceptions.cpp -o exceptions.o
g++ -shared -o Rcpp.so Date.o Module.o Rcpp_init.o Timer.o api.o attributes.o barrier.o exceptions.o -L/usr/lib/R/lib -lR
g++ -o libRcpp.so Date.o Module.o Rcpp_init.o Timer.o api.o attributes.o barrier.o exceptions.o -shared -L/usr/lib/R/lib -lR
ar qc libRcpp.a Date.o Module.o Rcpp_init.o Timer.o api.o attributes.o barrier.o exceptions.o
cp libRcpp.so ../inst/lib
cp libRcpp.a ../inst/lib
rm libRcpp.so libRcpp.a
installing to /usr/local/lib/R/site-library/Rcpp/libs
* R
* inst
* preparing package for lazy loading
Error : package 'codetools' was built before R 3.0.0: please re-install it
Error : unable to load R code in package 'Rcpp'
ERROR: lazy loading failed for package 'Rcpp'
* removing '/usr/local/lib/R/site-library/Rcpp'
* installing *source* package 'httpuv' ...
* package 'httpuv' successfully unpacked and MD5 sums checked
* libs
g++ -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -I./libuv/include -I./http-parser -I./sha1 -I./base64 -I"/usr/lib/R/site-library/Rcpp/include" -fpic -O3 -pipe -g -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
RcppExports.cpp:75:10: error: 'uint32_t' was not declared in this scope
RcppExports.cpp: In function 'SEXPREC* httpuv_run(SEXP)':
RcppExports.cpp:79:5: error: 'uint32_t' was not declared in this scope
RcppExports.cpp:79:14: error: expected ';' before 'timeoutMillis'
RcppExports.cpp:80:25: error: 'timeoutMillis' was not declared in this scope
RcppExports.cpp:80:38: error: 'run' cannot be used as a function
make: * [RcppExports.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package 'httpuv'
* removing '/usr/local/lib/R/site-library/httpuv'
ERROR: dependency 'httpuv' is not available for package 'shiny'
* removing '/usr/local/lib/R/site-library/shiny'
ОТРЕДАКТИРОВАНО:
Загрузка и установка Rcpp вручную дает мне:
sudo R CMD INSTALL Rcpp_0.10.6.tar.gz
Error : package 'codetools' was built before R 3.0.0: please re-install it
Поэтому я вручную загрузил и установил codetools и снова попробовал Rcpp:
sudo R CMD INSTALL codetools_0.2-8.tar.gz
sudo R CMD INSTALL Rcpp_0.10.6.tar.gz
Затем снова следовал инструкциям с веб-страницы Shiny из «Установить R» и «Установить блестящий» и получил аналогичную ошибку, но теперь с caTools
, bitops
и xtable
, поэтому я выполнил ручную установку каждого из них. Блеск был установлен правильно.
Затем последовали следующие шаги в инструкции.
Любые идеи, почему я получил эту ошибку «был построен до R 3.0.0»?
Rcpp
, есть строка:Error : package 'codetools' was built before R 3.0.0: please re-install it
. Попробуйте запуститьupdate.packages("codetools")
, а затем установить Shiny - person Scott Ritchie   schedule 08.01.2014update.packages(codetools)
этого не делает:> update.packages("codetools") > library(codetools) Error: package ‘codetools’ was built before R 3.0.0: please re-install it > update.packages("codetools")
- person 719016   schedule 08.01.2014