Я новичок в Р.
Я хотел бы использовать функцию R clustal в пакете ape для обработки моей последовательности ДНК, поэтому я могу использовать {pegas} для проведения дальнейшего анализа.
Однако, когда я впервые пробую пример, приведенный в руководстве:
clustal(woodmouse, pw.gapopen = 1, pw.gapext = 1, exec = "clustalw2")
Но я получил сообщение об ошибке:
/bin/sh: clustalw2: command not found
Error in file(file, "r") : cannot open the connection. In addition: Warning massage: In file(file, "r") : cannot open file '/var/folders/vm/fzyykk3x21g55fdvpctj7s900000gn/T//Rtmp0RjsMr/input_clustal.aln' :No such file or directory
Я хотел бы знать, как решить эту проблему? Кстати, я использую ОС Mac OS 10.9. Спасибо.