У меня есть два фрейма данных. Первый, df1
, представляет собой матрицу векторов с помеченными столбцами, как показано ниже:
df1 <- data.frame(A=rnorm(10), B=rnorm(10), C=rnorm(10), D=rnorm(10), E=rnorm(10))
> df1
A B C D E
-0.3200306 0.4370963 -0.9146660 1.03219577 0.5215359
-0.3193144 0.8900656 -1.1720264 -0.42591761 0.1936993
0.4897262 -1.3970806 0.6054637 0.12487936 1.0149530
0.3772420 0.8726322 0.3250020 -0.36952560 -0.5447512
-0.6921561 -0.6734468 0.3500812 -0.53373720 -0.6129472
0.2540649 -1.1911106 -0.3266428 0.14013437 1.0830148
0.6606825 -0.8942715 1.1099637 -1.52416540 -0.2383048
1.4767074 -2.1492360 0.2441242 -0.36136344 0.5589114
-0.5338117 -0.2357821 0.7694879 -0.21652356 0.3185631
3.4215916 -0.3157938 0.8895597 0.09946069 -1.0961730
Второй фрейм данных, df2
, содержит элементы, соответствующие colnames
из df1
. Пример:
group <- c("1", "1", "2", "2", "3", "3")
S1 <- c("A", "D", "E", "C", "B", "D")
S2 <- c("D", "B", "A", "C", "B", "A")
S3 <- c("B", "C", "A", "E", "E", "A")
df2 <- data.frame(group,S1, S2, S3)
> df2
group S1 S2 S3
1 A D B
1 D B C
2 E A A
2 C C E
3 B B E
3 D A A
Я хотел бы вычислить корреляции между векторами-столбцами в df1
, которые соответствуют помеченным элементам в df2
. В частности, векторы, соответствующие cor(df2$S1, df2$S2)
и cor(df2$S1, df2$S3)
.
Вывод должен быть примерно таким:
group S1 S2 S3 cor.S1.S2 cor.S1.S3
1 A D B 0.003825055 -0.2817946
1 D B C -0.2817946 -0.4928023
2 E A A -0.3856809 -0.3856809
2 C C E 1 -0.3862433
3 B B E 1 -0.3888541
3 D A A 0.003825055 0.003825055
Я пытался решить эту проблему с помощью cbind[]
, но продолжаю сталкиваться с такими проблемами, как ошибка 'x' must be numeric
с cor
. Заранее благодарю за любую помощь!