Среди известных ограничений вложенных наборов Джо Селко (модифицированный обход предварительного заказа) стоит отметить снижение производительности по мере роста дерева до большого размера.
Вадим Тропашко предложил вложенные интервалы и приводит примеры и теоретическое объяснение в этой статье: http://arxiv.org/html/cs.DB/0401014
Это жизнеспособное решение, есть ли какие-нибудь жизнеспособные примеры (на любом языке), абстрагированные от собственного уровня БД?