Я работаю с файлами netcdf, и есть некоторый анализ, который я проводил с CDO, а затем с R. Я хотел бы знать, можно ли «вызвать» CDO непосредственно из R в том же скрипте. . Я не уверен, как (я пытался с помощью System () вызывать команды ... но я не понимаю). Кто-нибудь знает об этом ?? Было бы возможно??
Спасибо заранее
Да, с помощью функции system () вы можете использовать bash (в Linux) вместе с обычными подпрограммами R.
Например, простой код для преобразования файла GRIB2 в NetCDF
file_grb2 = "001.grb2"
file_ncdf ="001.nc"
system(paste("cd ~/DATA/prate; cdo -f nc copy ",file_grb2,file_ncdf,sep=(" ")))
Помимо использования системной функции, теперь существует пакет R под названием ClimateOperators, который позволяет вам использовать операторы CDO и NCO непосредственно из R. Вот ссылка на репозиторий github:
https://github.com/markpayneatwork/ClimateOperators
systemпозволяет запускать практически все, что угодно, из R. Вопрос в том, может ли<anything>взаимодействовать. - person IRTFM schedule 20.06.2016