В стеке уже много таких вопросов... Я нашел довольно много, но это не решает мою проблему.
Это то, что я пробовал до сих пор. Переходим на сайт CRAN cran.r-project.org/web/packages/rgdal/index.html
мы видим, что для сборки этого пакета нам нужно
- GDAL >= 1.6.3, библиотека с trac.osgeo.org/gdal/wiki/DownloadSource и
- PROJ.4 (proj >= 4.4.9) с сайта download.osgeo.org/proj/;
Далее нам понадобятся зависимости
- Зависит: R (≥ 3.3.0), методы, sp (≥ 1.1-0)
Но они уже установлены.
Мы уже установили системные зависимости, так как
[]$ gdal-config --version
2.1.3
[]$ proj
Rel. 4.4.9, 29 Oct 2004
usage: proj [ -beEfiIlormsStTvVwW [args] ] [ +opts[=arg] ] [ files ]
Однако, когда мы пытаемся установить пакет с помощью
install.packages("rgdal_1.2-5.tar.gz",type = "source",repos = NULL,
configure.args=c('--with-proj-include=/usr/local/include','--with-proj-lib=/usr/local/lib'))
Параметры configure.args взяты из ответов, приведенных в установке пакета rgdal.
Однако мы все еще получаем ошибку при установке... это часть журнала
*** installing help indices
converting help for package ‘rgdal’
finding HTML links ... done
CRS-class html
GDALDataset-class html
GDALDriver-class html
GDALMajorObject-class html
GDALRasterBand-class html
GDALReadOnlyDataset-class html
GDALReadOnlyDataset-methods html
GDALTransientDataset-class html
GridsDatums html
RGB2PCT html
SGDF2PCT html
SpatialGDAL-class html
closeDataset-methods html
displayDataset html
llgrid html
Rd warning: /tmp/RtmppvlZ6x/R.INSTALL233feb7dc50/rgdal/man/llgrid.Rd:11: missing file link ‘Spatial’
Rd warning: /tmp/RtmppvlZ6x/R.INSTALL233feb7dc50/rgdal/man/llgrid.Rd:16: missing file link ‘gridat’
Rd warning: /tmp/RtmppvlZ6x/R.INSTALL233feb7dc50/rgdal/man/llgrid.Rd:17: missing file link ‘gridat’
make_EPSG html
nor2k html
projInfo html
project html
readGDAL html
Rd warning: /tmp/RtmppvlZ6x/R.INSTALL233feb7dc50/rgdal/man/readGDAL.Rd:136: missing file link ‘flipVertical’
readOGR html
showWKT html
spTransform-methods html
wrappers html
writeOGR html
** building package indices
** installing vignettes
** testing if installed package can be loaded
Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) :
unable to load shared object '/usr/lib64/R/library/rgdal/libs/rgdal.so':
libgdal.so.20: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: loading failed
Execution halted
ERROR: loading failed
* removing ‘/usr/lib64/R/library/rgdal’
Warning message:
In install.packages("rgdal_1.2-5.tar.gz", type = "source", repos = NULL) :
installation of package ‘rgdal_1.2-5.tar.gz’ had non-zero exit status
Обратите внимание, что предупреждения, которые срабатывают здесь, по-видимому, не являются стопором показа (как сказано на https://groups.google.com/forum/#!topic/batchjobs/TvwTbqrWFyU) Таким образом, кажется, что системные зависимости (GDAL и PROJ) выполняются... зависимости пакета (методы, sp) там также. Однако установка не может найти определенные файлы. Я знаю из stackoverflow, что вы можете указать определенные аргументы для команды install.packages() R... как показано в фрагменте кода выше.. так что это может быть что я не указываю достаточно путей... или что-то еще
Наконец, расположение gdal и proj на старом граничном узле определяется как
- гдал: /usr/local/lib/libgdal.so.20
- проект: /usr/local/lib/libproj.so.0 11:26:32
Можете ли вы, ребята, подсказать, куда идти отсюда?
