Невозможно оценить стандартные ошибки, связанные с веганской функцией fisher.alpha

Все документы, связанные с BiodiversityR и Vegan, предполагают, что аргумент se=TRUE можно использовать для оценки стандартных ошибок при вычислении индекса альфа-разнообразия Фишера. Но я не могу получить эти значения на выходе? Кто-нибудь знает о какой-либо связанной с этим ошибке?

Я пытался :

fisher.alpha(x,MARGIN=1,se=TRUE)

а также fisherfit(x)

Результат для обоих дает мне оценку альфа, но без стандартных ошибок. Мой фрейм данных сообщества слишком велик для загрузки сюда, но он имеет стандартный формат, как того требуют эти функции.

  • Веганская версия 2.4.2

r vegan
person Mansi    schedule 26.04.2017    source источник
comment
Я только что узнал, что оценка стандартных ошибок для альфы была удалена авторами 4 года назад, так как значения альфы не являются нормальными и искажены, поэтому стандартные ошибки не очень полезны.   -  person Mansi    schedule 26.04.2017

Ответы (1)


arrow_upward
1
arrow_downward

Стандартные ошибки были удалены не потому, что они были ненормальными и искажены, а потому, что я не был уверен, что они верны. (Нет ничего плохого в том, чтобы быть ненормальным и искаженным.). Если вы хотите поиграть с этими стандартными ошибками, вы можете получить vegan версии 2.0-9 из архива CRAN или отменить фиксацию 2c44f2b7c9 в дереве github vegan. Однако вам следует самостоятельно проверить правильность этих стандартных ошибок: они могут быть в порядке, но я не знаю, поэтому я их удалил.

person Jari Oksanen    schedule 27.04.2017
comment
Понятно. Большое спасибо. Поищу это. - person Mansi; 27.04.2017