Можно ли использовать NMDS для проверки линейности данных путем сравнения результатов ординации Eucladion - BrayCurtis?

Я хочу сделать PCA (в R), но я не знаю, являются ли мои данные линейными. Я провел NMDS для Евклада и расстояния Брея-Кертиса. После удаления 1 переменной со многими нулями графики NMDS примерно равны.

Я предполагаю, что линейные данные, нанесенные на график в нелинейном пространстве ординации (Брэя-Кертиса), приводят к тем же результатам, что и линейные данные, нанесенные на график в линейном пространстве ординации (евклидовом). Обосновано ли это предположение?

Спасибо!!


person Els    schedule 15.08.2017    source источник


Ответы (1)


Для решения о линейности/унимодальности данных попробуйте использовать функцию decorana из пакета vegan для построения DCA и проверки длины оси как рекомендовано здесь.

person tlask    schedule 21.01.2018