Ошибка установки пакета пакета kohonen для R

Я попытался установить пакет «kohonen», и это результат при попытке запустить его.

> require(kohonen)
Le chargement a nécessité le package : kohonen
Error: package or namespace load failed for ‘kohonen’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 impossible de charger l'objet partagé '/home/sebastien/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/libs/Rcpp.so':
  ~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4/Rcpp/libs/Rcpp.so: symbol _ZTTNSt7__cxx1118basic_stringstreamIcSt11char_traitsIcESaIcEEE, version GLIBCXX_3.4.21 not defined in file libstdc++.so.6 with link time reference

Я пытался понять, что происходит, но не нашел, как это исправить. у меня убунту 14.04

Я видел, что это можно исправить, понизив версию gcc до 4.x (возможно, 4.2, так как пакет успешно установлен на моем latpopo с этой версией gcc)

Текущая версия:

$ gcc --version
gcc (Homebrew gcc 5.4.0) 5.4.0

Я видел, что у вас может быть установлено несколько версий gcc, но я не знаю, как указать gcc, используемый R.


РЕДАКТИРОВАТЬ Я пытался использовать gcc 4.8, и R использует его. Но это не решило мою проблему...


РЕДАКТИРОВАТЬ 2

Это может быть связано с GLIBCXX_3.4.21 и libstdc++.so.6 с

Но у меня GLIBCC3.4.21

sebastien@sebastien-LABOFARM-HP-Z640-Workstation:~/.R$ strings /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX
GLIBCXX_3.4
GLIBCXX_3.4.1
GLIBCXX_3.4.2
GLIBCXX_3.4.3
GLIBCXX_3.4.4
GLIBCXX_3.4.5
GLIBCXX_3.4.6
GLIBCXX_3.4.7
GLIBCXX_3.4.8
GLIBCXX_3.4.9
GLIBCXX_3.4.10
GLIBCXX_3.4.11
GLIBCXX_3.4.12
GLIBCXX_3.4.13
GLIBCXX_3.4.14
GLIBCXX_3.4.15
GLIBCXX_3.4.16
GLIBCXX_3.4.17
GLIBCXX_3.4.18
GLIBCXX_3.4.19
GLIBCXX_3.4.20
GLIBCXX_3.4.21
GLIBCXX_3.4.22
GLIBCXX_3.4.23
GLIBCXX_3.4.24

sebastien@sebastien-LABOFARM-HP-Z640-Workstation:/usr/lib/x86_64-linux-gnu$ ll libstdc*
    lrwxrwxrwx 1 root root      19 août  20 21:01 libstdc++.so.6 -> libstdc++.so.6.0.24*
    -rwxr-xr-x 1 root root 1114368 août  20 21:15 libstdc++.so.6.0.24*

Наконец-то я проверил свой ноутбук, на котором работает пакет kohonen, и нашел это:

-rwxr-xr-x  1 root  wheel  1471104 12 mar  2016 libstdc++.6.0.9.dylib
lrwxr-xr-x  1 root  wheel       21 28 oct  2015 libstdc++.6.dylib -> libstdc++.6.0.9.dylib
lrwxr-xr-x  1 root  wheel       17 28 oct  2015 libstdc++.dylib -> libstdc++.6.dylib

Так что в основном я думаю, что моя проблема в том, что libstdС++ старше, поэтому пакет не будет работать. Я пытался обновить gcc, но он не обновляет libstdc++.


person Olorin.G    schedule 21.12.2017    source источник
comment
Или вы можете попробовать это: stackoverflow.com /вопросы/1616983/   -  person tushaR    schedule 21.12.2017


Ответы (2)


Хорошо, теперь некоторые из моих пакетов R больше не могут быть загружены.

Ошибка та же; я потерялся

person Olorin.G    schedule 21.12.2017

Итак, кажется, моя последняя ошибка исправляет исходные ошибки.

Я просто удалил все установленные пользователем пакеты R.

А то переустанавливаю некоторые пакеты, в т.ч. kohonen и все работает.

Возможно, некоторые пакеты (зависимости от kohonen) были скомпилированы компилятором другой версии gcc, и это все ломает.

person Olorin.G    schedule 21.12.2017