Проблема с поиском пакетов при попытке установить их в R

Я пытаюсь установить некоторые пакеты, в том числе «ggplot2», «GEOquery», «limma» и т. Д. Тем временем я продолжаю сталкиваться с одной из ошибок, упомянутых ниже: (И те же ошибки с другим репозиторием для «ggplot2» и "лимма")

install.packages("GEOquery")

Предупреждение в install.packages: невозможно получить доступ к индексу репозитория https://bioconductor.org/packages/3.9/bioc/src/contrib: невозможно открыть URL 'https://bioconductor.org/packages/3.9/bioc/src/contrib/PACKAGES '

Предупреждение в install.packages: пакет «GEOquery» недоступен (для R версии 3.6.0)


r install.packages
person pedram    schedule 08.06.2019    source источник
comment
Можете ли вы перейти по ссылке на ПАКЕТЫ в своем веб-браузере? Можете ли вы оценить команду read.dcf(url("https://bioconductor.org/packages/3.9/bioc/src/contrib/PACKAGES")) в R?   -  person Martin Morgan    schedule 08.06.2019
comment
Я мог открыть ссылку в моем браузере. Но у меня есть указанная ниже ошибка при попытке запустить предложенную вами команду: Error in read.dcf(url("https://bioconductor.org/packages/3.9/bioc/src/contrib/PACKAGES")) : cannot open the connection In addition: Warning message: In read.dcf(url("https://bioconductor.org/packages/3.9/bioc/src/contrib/PACKAGES")) : InternetOpenUrl failed: 'P¼' @MartinMorgan   -  person pedram    schedule 09.06.2019

Ответы (1)


arrow_upward
0
arrow_downward

Следуйте предложению здесь и попробуйте options(download.file.method="libcurl")).

person Martin Morgan    schedule 09.06.2019