Какие пакеты R подходят для построения графика передачи заболеваний во времени?

Я пытаюсь найти способ построить дерево передачи болезней, которое позволит мне:

  • построить дерево на временной шкале (временная шкала, охватывающая 2 месяца)
  • укажите форму и цвет узлов в дереве (например, чтобы вы могли легко определить, какие узлы принадлежат одному и тому же домохозяйству)
  • отформатируйте связь между узлами (пунктирные линии, двусторонние стрелки, сплошные линии и т. д.)
  • построить «случайные ветви», не связанные с корневым / родительским узлом.

Набор данных, с которым я работаю, относительно невелик (22 узла), поэтому я не против работать с пакетом, который немного неудобен!

Я думал об использовании деревьев филогении, но не уверен, позволят ли они мне строить случайные узлы. Какой пакет лучше всего подходит для этой задачи?

Спасибо!


person Dieu94    schedule 05.06.2020    source источник


Ответы (1)


Попробуйте DiagrammeR. У меня нет большого опыта, но он сделал то, что мне нужно было сделать, и я знаю, что едва прикоснулся к тому, на что он способен.

person Limey    schedule 05.06.2020