Я пытаюсь найти способ построить дерево передачи болезней, которое позволит мне:
- построить дерево на временной шкале (временная шкала, охватывающая 2 месяца)
- укажите форму и цвет узлов в дереве (например, чтобы вы могли легко определить, какие узлы принадлежат одному и тому же домохозяйству)
- отформатируйте связь между узлами (пунктирные линии, двусторонние стрелки, сплошные линии и т. д.)
- построить «случайные ветви», не связанные с корневым / родительским узлом.
Набор данных, с которым я работаю, относительно невелик (22 узла), поэтому я не против работать с пакетом, который немного неудобен!
Я думал об использовании деревьев филогении, но не уверен, позволят ли они мне строить случайные узлы. Какой пакет лучше всего подходит для этой задачи?
Спасибо!