Как установить SciPy на Apple Silicon (ARM / M1)

Я успешно установил python 3.9.1 с Numpy и Matplotlib на новый Mac mini с Apple Silicon. Однако я не могу установить SciPy: я получаю ошибки компиляции при использовании

python3 -m pip установить scipy

Я также попытался установить все из brew, и import scipy работает, но его использование дает ошибку seg. Я установил ARM-версии lapack и openblas, но это не решает проблему.

У кого-нибудь получилось? (Мне интересно запускать его изначально, а не через Rosetta).


python apple-silicon apple-m1 scipy arm
person David Sénéchal    schedule 16.01.2021    source источник

Ответы (5)


arrow_upward
23
arrow_downward

Возможна установка на обычный питон arm64 brew, нужно его скомпилировать самостоятельно.

Сначала мне пришлось скомпилировать numpy, для чего требуются cython и pybind11:

pip3 install cython pybind11

Тогда numpy можно скомпилировать:

pip3 install --no-binary :all: --no-use-pep517 numpy

Затем нам нужно скомпилировать сам scipy, это зависит от fortran и BLAS / LACK:

brew install openblas gfortran

Скажите scipy, где можно найти эту библиотеку:

export OPENBLAS=/opt/homebrew/opt/openblas/lib/

Затем, наконец, compilescipy:

pip3 install --no-binary :all: --no-use-pep517 scipy
person TheRijn    schedule 08.03.2021
comment
Мне пришлось brew install openblas gfortran перед numpy ... numpy нужен был хотя бы openblas - person Anentropic; 09.03.2021
comment
К сожалению, компиляция SciPy завершилась неудачно с error: Command "ar rcs build/temp.macosx-10.14.6-arm64-3.8/libsuperlu_src.a build/temp.macosx-10.14.6-arm64-3.8/scipy/sparse/linalg/dsolve/SuperLU/SRC/dlaqgs.o [………]" failed with exit status 1 :( - person MattiSG; 17.03.2021
comment
Этот ответ сработал для меня в OSX 11.2.3 (20D91) с MacBook Pro (13 дюймов, M1, 2020). У меня не было ошибок компиляции, как @MattiSG - person Greg Hilston; 01.04.2021
comment
У меня это сработало, но впоследствии scikit-learn (pip install sklearn) - нет. Я поднял это, потому что заметки на scikit- learn.org/stable/ и ссылка на github там предлагают (для моих глаз новичков), что sklearn следует установить при успешной установке scipy. Прежде чем задать новый вопрос, я подумал, что люди, которые немного поработали, также могут дать совет по этой связанной проблеме. - person user1071516; 27.05.2021
comment
Мне нужен pip install pythran - person Golf Monkey; 13.07.2021

arrow_upward
5
arrow_downward

Вы можете установить miniforge из https://github.com/conda-forge/miniforge#miniforge3 а затем установите эти пакеты с помощью,

conda install numpy scipy matplotlib
person isuruf    schedule 17.01.2021
comment
Я сделал. Это вызывает segfault всякий раз, когда я импортирую подмодуль scipy. Однако Numpy и matplotliib в порядке. - person David Sénéchal; 17.01.2021
comment
Теперь это работает! Спасибо! - person David Sénéchal; 17.01.2021
comment
Вы также можете установить miniforge с помощью brew: brew install --cask miniforge - person climatebrad; 09.02.2021
comment
Спасибо! Установка сработала для меня, однако я застрял с импортом установленных пакетов в виртуальных средах, где мои локальные пакеты игнорировались. Решение описано здесь: stackoverflow.com/questions/66768259/ - person MattiSG; 24.03.2021

arrow_upward
2
arrow_downward

Для меня самые простые решения:

brew install scipy

Вероятно, хорошая идея отредактировать PATH, поэтому по умолчанию будет версия homebrew.

person arkhein    schedule 28.04.2021
comment
Обратите внимание, что если вы это сделаете, brew установит python3.9 в этом месте /opt/homebrew/Cellar/[email protected]/3.9.6/bin/python3, и вы сможете импортировать scipy, только если запустите этот исполняемый файл python - person cmoses; 08.07.2021

arrow_upward
2
arrow_downward

Это решение работало на моем компьютере M1 с pyenv:

brew install openblas
OPENBLAS="$(brew --prefix openblas)" pip install numpy scipy
person dwolfeu    schedule 18.05.2021

arrow_upward
0
arrow_downward

Мне удалось установить scipy на Apple Silicon. В основном я следовал инструкциям lutzroeder здесь: https://github.com/scipy/scipy/issues/13409

Эти инструкции для меня не увенчались успехом, но после этого сработал запуск pip3 install scipy. Я думаю, это решило проблему для меня:

/opt/homebrew/bin/brew install openblas

export OPENBLAS=$(/opt/homebrew/bin/brew --prefix openblas)

export CFLAGS="-falign-functions=8 ${CFLAGS}"
person hobozero    schedule 04.06.2021